PC提案事例

事例No.PC-8617Aを見ての問い合わせ。
分子シミュレーションによる立体構造モデリングや低分子化合物スクリーニングを行うためのマシンを導入したい。
ストレージはミラーリング (RAID1) が可能な構成で、23インチ程度のディスプレイとテクニカルサポートを含めた内容で提案して欲しい。

事例No.PC-8617Aをベースに検討しました。

OSは、CPUコア数の多い構成に適したWindows 10 Pro for Workstationとしています。

ストレージはご希望に合わせてRAID1に対応した構成でご用意しました。
PC-8617AではM.2 SSDでしたが、RAID1の構築に対応させるため、M.2からS-ATAに変更しています。

なお、PC-8617Aとの大きな違いは5年間の延長保証 (テクニカルサポート) の有無です。
保証内容の詳細は、下記リンクよりご確認いただけます。

参考：「あんしん＋」　もしもの時の延長保証サービス

その他の構成変更につきましても、お客様のご要望に合わせて承りますのでお気軽にご相談ください。

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画像系深層学習のトレーニング フェーズ (Deep Neural Networkがネットワークの重みやバイアスを自動調整するフェーズ) で用いるGPUマシンが欲しい。
予算300万円以下で、A5000を4枚搭載した構成を希望する。家庭用電源環境 (100V) で動作可能な静音性の高い構成を導入したい。
その他、2TB程度のストレージと、Ubuntu 18.x もしくは 20.x を条件としたい。

ご要望を踏まえて構成を検討しました。
NVIDIA RTX A5000の最大消費電力は、1台あたり230Wとハイエンド製品としては比較的低く抑えられているため、4台搭載しても家庭用電源で利用が可能です。本事例の構成も100V、1系統での給電を前提としています。

筐体も静音性を重視して選定していますが、拡張スロットを2つ占有するカードを4台搭載する都合上、8スロット分のスペースが必要です。一般的なミドルタワー筐体では、ATXフォームファクターの7スロット分しかスペースが確保されていないため、筐体は必然的にE-ATXなどに対応した大型の製品を選択することになります。

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量子化学計算ソフト Gaussian用の計算サーバーが欲しい。
GaussianとGromacsができるだけ高速に動くマシンが希望で、予算は200万円程度を想定している。
具体的には、以下のスペックと同等の構成が理想。

・CPU：Xeon Gold 6354 (18core 3.0GHz 205W) x2
・メモリ：256GB
・SSD：960GB SATA x2　システム用とバックアップ用に1台ずつ
・GPU：NVIDIA RTX A6000 x2
・OS：AlmaLinux 8.3

なお、GromacsはGPUでの運用を、GaussianはCPUでの運用を検討している。

ご予算に対応させるためGPUの台数を1台とし、CPUもコア数の少ない製品に変更した構成をご提案しました。

Gromacsは、メーカーにて特定のGPUモデルが指定されていないため、RTX A6000でも利用可能と考えられますが、もう一方のGaussian 16のGPGPUはRTX A6000を公式サポートしていません。
Gaussian 16でサポートされているのは、V100やA100といった倍精度演算に対応したGPGPU専用カードのみとなっています。

A6000での動作に関してお客さま側で情報をお持ちであれば問題ありませんが、そうでない場合はGPUの選択を見直していただいたくのが良いかもしれません。

なお、GPUをサポート対象のA100に変更する場合、カード仕様との兼ね合いからベース構成を変更する必要があります。
Gaussian 16ではCPU実行のみ利用する場合、GPUの選択はGaussian 16の動作に影響しません。

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事例No.PC-7673Aを見ての問い合わせ。メタゲノム解析用のマシンの導入を検討している。
隠れマルコフモデルを使用したバイオシーケンス分析を行うソフトウェア HMMER を、高速で動かすことのできるマシンを提案して欲しい。
想定しているスペック・条件は以下の通り。

・CPU： x86系
・メモリ： 128GB以上
・SSD： 2TB 以上
・HDD ： 10TB 以上
・OS： Ubuntu
・予算： 100万円程度

事例No.PC-7673Aの構成を踏まえつつ、ご予算と指定の要件に合わせて改めて検討しました。

OSは現時点で正式にリリースされている最新のLTSとして、Ubuntu 20.04を選択しています。
また、CPUにはPC-7673Aよりも新しい第3世代 Xeon Scalableを選択しています。
CPUのモデルやその他のスペックは、ご予算に合わせた暫定での構成として選択しています。お客様ごとのご要望・条件に合わせて検討しますので、お気軽にご相談ください。