事例No.PC-TE1J254011

シーケンスデータ解析/機械学習用ワークステーション (システム要件に最適化)

用途:エピジェネティクス解析、de novoアセンブリ、RNA-Seq解析、メタゲノム解析、機械学習
参考価格:3261500

お客さまからのご相談内容

事例No. PC-25000268を見ての問い合わせ。ナノポアのシーケンスデータ解析と機械学習の双方に対応するワークステーションを導入したい。

エピジェネティクス解析やde novoアセンブリ、RNA-Seq解析、メタゲノム解析などを想定している。
使用するソフトウェアは、以下の通り。

  • 汎用解析・ML基盤:Samtools、XGBoost、LightGBM
  • ゲノムアセンブリ・評価:SPAdes・BUSCO・Prodigal・FastANI・GTDB-Tk
  • ナノポアベースコール:Guppy・Dorado・Remora・DeepMod2

OSはUbuntuで、予算は400万円程度を希望する。設置作業も含めた見積もりが欲しい。

テガラからのご提案

ツール要件を重視した大容量メモリ構成

本構成は「システム要件を基準に最適化した構成」としてご案内したスペックです。特に大規模アセンブリや多数サンプルのバッチ処理を想定し、CPUコア数とメモリ容量を優先。EPYC 9554 (64コア) と768GBメモリにより、メモリ負荷の大きい解析に強みを持たせています。

事例No. PC-25000268をグレードアップしつつ、機械学習にも対応できる汎用性を重視した構成は、事例No.PC- TW3J253928をご覧ください。

CPUについて

AMD EPYC 9554は64コア構成で高い並列処理性能を備え、大量のサンプルを並行処理するワークロードに適しています。CPUリソースを多く要求するゲノム解析ツールや、複数ジョブを同時実行する環境で効率を発揮します。

メモリ容量について

ご利用予定のソフトウェアには、推奨メモリ容量が256GB~512GB付近のツールが複数存在します。そのため、解析規模や将来のデータ拡張を踏まえ、余裕を持った768GBを搭載しました。長時間ジョブの安定性向上にも寄与します。

GPUの選定について

本構成では、研究用途における機械学習処理への対応を目的に NVIDIA RTX 6000 Ada (Max-Q 96GB) を搭載しています。
深層学習フレームワークとの高い親和性を持ち、モデル学習や推論処理において高い実用性を発揮します。

Doradoについては、GPUアクセラレーションを利用する際に倍精度演算を前提としたハイエンドGPUが例示されています。
そこで今回は、Doradoの高精度GPU要件をそのまま満たす構成ではなく、機械学習を中心に幅広い研究用途へ柔軟に対応できる現実的かつ効果的な選択肢として、RTXシリーズを採用した構成としました。

RTXシリーズは深層学習フレームワークとの相性もよく、多様な研究タスクに対応しやすい点が特長です。今後の拡張やワークフローの進化にも柔軟に応えられる構成となっています。

参考情報:Dorado GPU要件

参考情報:Benchmarking the Oxford Nanopore Technologies basecallers on AWS

ストレージと運用性

高速アクセスが必要なワークフローに合わせ、4TB NVMe Gen5 SSD を2基搭載し、高速な一時データ処理に対応しています。
また、24TB HDD を併用することで、シーケンスデータの長期保管や再解析にも適したストレージ構成としました。
さらに、現地での設置作業 (開梱・設定・起動確認) も含めて対応し、導入後すぐに研究へ着手いただけるよう配慮しています。

運用要件に寄り添った最適化

納期や予算条件を満たしつつ、求められた要件に最も合致するスペックとして構成しました。多様なツールを運用する研究環境で、安定した解析パイプラインを維持しやすい点が特長です。

 

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。

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ストレージ選定のポイント お客様の声

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通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU AMD EPYC 9554 3.1GHz 64C/128T
メモリ 合計512GB DDR5 5600 REG ECC 64GB x 8
ストレージ1 4TB SSD M.2 NVMe Gen5 x 2
ストレージ2 24TB HDD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX PRO6000 Max-Q 96GB
ネットワーク on board (10GBase-T x2)
筐体+電源 ミドルタワー 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04
その他 現地設置作業(開梱・設置・ケーブリング・起動確認)

キーワード

・Samtoolsとは
Samtoolsは、次世代シーケンス (NGS) データの処理・解析に広く用いられる定番ツール群。BAMやCRAMなどのアライメントデータのソート、インデックス作成、フィルタリング、可視化などの高速処理が可能で、ゲノム解析ワークフローの基盤として広く利用されている。

参考:GitHub – samtools/samtools: Tools (written in C using htslib) for manipulating next-generation sequencing data

・XGBoostとは
XGBoostは、勾配ブースティング決定木 (GBDT) アルゴリズムを高速かつ高精度に実装した機械学習フレームワーク。分類・回帰・ランキングなど多用途で、ゲノム解析、疾患リスク予測、遺伝子発現解析などバイオインフォマティクス分野でも広く利用される。

https://xgboost.ai/参考:XGBoost Official Site

・LightGBMとは
LightGBMは、Microsoftが開発した高速でメモリ効率の高い勾配ブースティングフレームワーク。大規模データの解析に適しており、SNP解析、メチル化データの分類、疾患予測モデルなどにも利用される。

参考:LightGBM Documentation

・SPAdesとは
SPAdesは、微生物ゲノムアセンブリに広く利用されるde novoアセンブラー。Illumina・Nanopore・PacBioなど複数プラットフォームを統合したハイブリッドアセンブリに対応し、高品質なコンティグ構築が可能。

参考:SPAdes – Genome Assembly Toolkit

・BUSCOとは
BUSCOは、ゲノムアセンブリの完全性 (completeness) を評価するための代表的ツール。保存性の高いシングルコピー遺伝子セットを用い、アセンブリ品質の客観的評価が可能。

参考:リリース · ezlab / busco · GitLab

・Prodigalとは
Prodigalは、微生物ゲノムに特化した遺伝子予測ツール。プロカリア遺伝子領域の高精度抽出が可能で、メタゲノム解析でも高い性能を発揮する。

参考:Prodigal – Fast and accurate gene prediction

事例追加日:2026/2/12
事例No.PC-TW3J253928

シーケンスデータ解析/機械学習用ワークステーション (汎用構成)

用途:エピジェネティクス解析、de novoアセンブリ、RNA-Seq解析、メタゲノム解析、機械学習
参考価格:3169100

お客さまからのご相談内容

事例No. PC-25000268を見ての問い合わせ。ナノポアのシーケンスデータ解析と機械学習の双方に対応するワークステーションを導入したい。

エピジェネティクス解析やde novoアセンブリ、RNA-Seq解析、メタゲノム解析などを想定している。
使用するソフトウェアは、以下の通り。

  • 汎用解析・ML基盤:Samtools、XGBoost、LightGBM
  • ゲノムアセンブリ・評価:SPAdes・BUSCO・Prodigal・FastANI・GTDB-Tk
  • ナノポアベースコール:Guppy・Dorado・Remora・DeepMod2

OSはUbuntuで、予算は350万円程前後を希望する。

テガラからのご提案

機械学習を見据えたバランス強化構成

本構成は「事例No. PC-25000268をグレードアップしつつ、機械学習にも対応できる汎用性」を重視した案としてご案内しました。Xeon W プロセッサと512GBメモリを組み合わせ、シーケンス解析に必要なスループットと、機械学習処理に必要な演算性能の両立を図っています。

システム要件を基準に最適化した構成は、事例No.PC- TE1J254011をご覧ください。

CPUについて

Intel Xeon W7-3565X (32コア) は高クロックで単一タスク性能に優れ、ツールによって負荷特性が分かれるゲノム解析と機械学習処理の双方に適した選択です。計算処理の一部がCPU性能に依存するソフトウェア環境に向いています。

GPUの選定について

本構成では、機械学習の活用を見据え、GPUを搭載しています。
シーケンス解析のワークフローではCPU主導の処理が多い一方、機械学習を取り入れる研究ではGPUの存在が大きな効果を発揮するため、研究の幅を広げる観点からもGPU追加を採用しました。

Doradoについては、GPUアクセラレーションを利用する際に倍精度演算を前提としたハイエンドGPUが例示されています。
そこで今回は、Doradoの高精度GPU要件をそのまま満たす構成ではなく、機械学習を中心に幅広い研究用途へ柔軟に対応できる現実的かつ効果的な選択肢として、RTXシリーズを採用した構成としました。

RTXシリーズは深層学習フレームワークとの相性もよく、多様な研究タスクに対応しやすい点が特長です。今後の拡張やワークフローの進化にも柔軟に応えられる構成となっています。

参考情報:Dorado GPU要件

参考情報:Benchmarking the Oxford Nanopore Technologies basecallers on AWS

拡張性について

大型のミドルタワー筐体を採用することで、将来的なストレージ増設やGPUの追加にも柔軟に対応できます。研究用途の変化に合わせて活用範囲を広げやすい点が特長です。

 

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。

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ストレージ選定のポイント お客様の声

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主な仕様

CPU Intel Xeon W7-3565X 2.50GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 32C/64T
メモリ 合計512GB DDR5 5600 REG ECC 64GB x 8
ストレージ1 4TB SSD M.2 NVMe Gen5
ストレージ2 24TB HDD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX PRO5000 48GB
ネットワーク on board (1GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 ミドルタワー筐体 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04

キーワード

・Samtoolsとは
Samtoolsは、次世代シーケンス (NGS) データの処理・解析に広く用いられる定番ツール群。BAMやCRAMなどのアライメントデータのソート、インデックス作成、フィルタリング、可視化などの高速処理が可能で、ゲノム解析ワークフローの基盤として広く利用されている。

参考:GitHub – samtools/samtools: Tools (written in C using htslib) for manipulating next-generation sequencing data

・XGBoostとは
XGBoostは、勾配ブースティング決定木 (GBDT) アルゴリズムを高速かつ高精度に実装した機械学習フレームワーク。分類・回帰・ランキングなど多用途で、ゲノム解析、疾患リスク予測、遺伝子発現解析などバイオインフォマティクス分野でも広く利用される。

https://xgboost.ai/参考:XGBoost Official Site

・LightGBMとは
LightGBMは、Microsoftが開発した高速でメモリ効率の高い勾配ブースティングフレームワーク。大規模データの解析に適しており、SNP解析、メチル化データの分類、疾患予測モデルなどにも利用される。

参考:LightGBM Documentation

・SPAdesとは
SPAdesは、微生物ゲノムアセンブリに広く利用されるde novoアセンブラー。Illumina・Nanopore・PacBioなど複数プラットフォームを統合したハイブリッドアセンブリに対応し、高品質なコンティグ構築が可能。

参考:SPAdes – Genome Assembly Toolkit

・BUSCOとは
BUSCOは、ゲノムアセンブリの完全性 (completeness) を評価するための代表的ツール。保存性の高いシングルコピー遺伝子セットを用い、アセンブリ品質の客観的評価が可能。

参考:リリース · ezlab / busco · GitLab

・Prodigalとは
Prodigalは、微生物ゲノムに特化した遺伝子予測ツール。プロカリア遺伝子領域の高精度抽出が可能で、メタゲノム解析でも高い性能を発揮する。

参考:Prodigal – Fast and accurate gene prediction

事例追加日:2026/2/12
事例No.PC-TW3M253260

クライオ電子顕微鏡画像解析ワークステーション

用途:クライオ電子顕微鏡の大量画像から三次元構造を再構築する解析処理
参考価格:9419300

お客さまからのご相談内容

クライオ電子顕微鏡の大量画像から三次元構造を再構築する解析処理を目的としたワークステーションを希望。
大量画像の三次元構造再構成を想定し、複数の解析ソフトウェアをLinux環境で運用したい。RELIONやCryoSPARCをはじめとしたLinux向け解析ソフトウェアの利用を想定している。

予算は約1,000万円で、研究効率向上のためGPU性能を重視したい。

テガラからのご提案

GPU構成について

解析処理ではGPUの枚数だけでなく、VRAM容量や長時間運用での安定性が重要になります。そこで、ワークステーションとして最良の性能バランスを発揮できる構成として、NVIDIA RTX PRO 6000 Max-Q (96GB) を4枚搭載する方式をご提案しました。
このGPUは大容量VRAMを備えており、大規模データを扱う解析でも余裕をもって処理できる点が特長です。総メモリ帯域もしっかり確保でき、各種解析ソフトにおいて安定した処理性能を発揮できる構成です。

CPUとメモリについて

GPU処理と並行して大量のメタデータや中間ファイルを扱うため、Xeon Wシリーズを採用し、メモリは512GBを搭載しました。
GPU総VRAMを上回るメモリ容量を確保することで、RELIONやCryoSPARCなどでの大規模タスクでも処理が滞りにくく、長時間の解析でも安定性を維持できます。

ストレージとOS構成

複数の解析ソフトを利用されるため、依存関係やバージョン差異に強い Ubuntu 24.04 を標準OSとして選定しました。
ストレージは高速アクセスを重視し、1TB+4TB NVMe SSDの2構成としています。解析データの読み書き負荷にも対応できるバランスを確保しています。

筐体と電源設計

GPU4枚構成を安定運用するため、排熱性能に優れたGPGPU用フルタワー型筐体を採用しました。
電源は2800Wの大容量製品を採用しており、継続稼働と負荷変動に強い設計です。
高負荷が続く研究用途でも安心して運用いただける構成としています。

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お客様の声 画像解析向けマシン選定のポイント
ストレージ選定のポイント

 

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通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

 

主な仕様

CPU Intel Xeon W7-3545 2.70GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 24C/48T
メモリ 合計512GB DDR5 5600 REG ECC 64GB x 8
ストレージ1 1TB SSD M.2 NVMe Gen4
ストレージ2 4TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA RTX PRO 6000 Max-Q 96GB x 4
ネットワーク on board (1GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 GPGPU用フルタワー型シャーシ 2800W Titanium
OS Ubuntu 24.04

キーワード

・RELIONとは
RELION (REgularised LIkelihood OptimisatioN) は、クライオ電子顕微鏡 (cryo-EM) データを用いた三次元再構成に広く利用されるソフトウェア。ベイズ推定に基づく高精度な粒子分類・3D再構築・構造精密化を特徴とし、構造生物学や蛋白質複合体解析において標準的な解析ツールとなっている。大規模GPUアクセラレーションに対応し、高速かつ高解像度の構造解析が可能。

参考:RELION 4.0 Installation Guide(relion.readthedocs.io)

・cryoSPARCとは
cryoSPARCは、クライオ電子顕微鏡 (cryo-EM) データの高速処理と高解像度リファインメントを統合した解析プラットフォーム。粒子ピッキング、2D分類、ab initio再構成、均一および非均一リファインメントなど多彩なワークフローを提供し、GPU最適化による高速処理が強み。大規模構造解析、複合体ダイナミクス研究、ハイスループット解析に広く利用されている。

参考:cryoSPARC Hardware & System Requirements(guide.cryosparc.com)

事例追加日:2026/2/12
事例No.PC-TUKM253145

AlphaFold3/GNINA向けワークステーション

用途:タンパク質構造予測、リガンド結合予測
参考価格:1054900

お客さまからのご相談内容

AlphaFold3やGNINAを用いた解析を学び、研究に活用するためのワークステーションを導入したい。
予算は100万円程度を想定している。
この予算内でおすすめの構成を提案してほしい。

テガラからのご提案

GPUの選定について

AlphaFold3はVRAM容量など、GPU性能が重視されるソフトウェアになります。
ご予算内で最大のAlphaFold3計算性能を得るため、NVIDIA GeForce RTX5090 (32GB) を採用しました。
RTX5090は最新世代のコア性能により、多くの研究用途でパフォーマンスを発揮します。
また、大規模モデルなどでVRAM容量が重要な場合は、容量優先でのGPU選定も可能です。

CPUとメモリ構成について

CPUにはCore Ultra 7 265Kを、メモリは64GB (32GB×2枚) を搭載しました。
AlphaFold3の推奨メモリ容量は64GB以上です。
本構成では64GBのメモリを搭載することで解析の安定性を確保しています。
さらに、空きスロットを活用することで、メモリ容量を最大128GBまで拡張可能です。

AlphaFold3 関連情報

テグシスでは、Ubuntu 24.04に対応したAlphaFold3のインストール手順を公開しています。
準備段階からAlphaFold3の起動まで、具体的なコマンドを掲載しています。
詳細な情報は、以下のリンクをご確認ください。

次世代たんぱく質構造予測モデル「AlphaFold3」 インストール手順 (Ubuntu 24.04対応)

AlphaFold3用途向けのワークステーション提案事例は、こちらの記事でも詳しく紹介しています。

参考:事例No.PC-TRNM253239 機械学習・DFT計算 両立ワークステーション

このような分野で活躍されている方へ

  • 計算化学
  • 構造生物学
  • バイオインフォマティクス
  • 分子モデリング
  • たんぱく質工学

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。

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オミクス解析用PC 選び方ガイド ストレージ選定のポイント
バイオインフォマティクス向け マシン選定のポイント お客様の声

この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

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主な仕様

CPU Intel Core Ultra 7 265K 3.90GHz(8C/8T)+3.30GHz(12C/12T)
メモリ 合計64GB DDR5 6400 32GB x 2
ストレージ1 1TB SSD M.2 NVMe Gen5
ストレージ2 4TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA GeForce RTX5090 32GB
ネットワーク on board(2.5GBase-T x1) Wi-Fi,Bluetooth
筐体+電源 ミドルタワー筐体 1200W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04

キーワード

・AlphaFoldとは
AlphaFoldは、DeepMindが開発した革新的なタンパク質構造予測AI。
アミノ酸配列から高精度な立体構造を予測することが可能で、従来の実験的手法 (X線結晶構造解析やNMR) に比べて圧倒的なスピードとコスト効率を実現。
構造生物学、創薬、酵素設計、疾患研究など幅広い分野で活用されており、AlphaFold Protein Structure Databaseを通じて数百万の構造情報が公開されている。

参考:AlphaFold – DeepMind

・Gninaとは
Gninaは、深層学習 (ディープラーニング) を用いた分子ドッキングおよびスコアリングを実現するオープンソースソフトウェア。CNN (畳み込みニューラルネットワーク) ベースのスコアリング関数を備え、従来のAutoDock Vina系アルゴリズムと統合することで、リガンド‐タンパク質相互作用の予測精度を向上させる。創薬計算、分子シミュレーション、構造ベースドラッグデザイン (SBDD) に広く利用されている。

参考:GitHub – gnina/gnina

事例追加日:2026/2/4
事例No.PC-TUKS254357

Nanopore MinION Mk1D対応省スペースワークステーション

用途:Oxford Nanopore MinION Mk1D、シーケンス解析
参考価格:416900

お客さまからのご相談内容

Oxford Nanopore MinION Mk1D の推奨要件を満たすスペックで、卓上設置が可能なPCを導入したい。予算は47万円以内。
OSはUbuntu 24.04 LTS、メモリ32GB、ストレージ2TB SSD、CPUはIntel i7 (12コア以上) を条件とする。
GPUはNVIDIA RTX 5090か、ラップトップ向けGPUを希望するが、難しい場合は最小要件でも可。
拡張性よりも省スペース性を重視したい。

参考:MinION Mk1D IT要件 _ Oxford Nanopore Technologies

テガラからのご提案

GPUの選定と予算調整

推奨要件を満たす構成を検討しました。
RTX 5090を採用する場合は、ご予算の47万円を大幅に上回ります。
そのため、今回のご提案ではOxford Nanopore MinION Mk1D の最小要件を満たすGeForce RTX 5060Ti (16GB) を選定しています。
CPUはIntel Core Ultra 7 (8+12コア) 、メモリ32GB、ストレージ2TB SSDを搭載。性能と予算のバランスを実現した構成です。

コンパクト筐体の採用

省スペース性を重視した「Define7 Compact」を採用しています。
サイズは幅210mm×高さ474mm×奥行427mmで、限られたスペースでも快適に運用可能です。

一方で、筐体サイズおよびエアフロー設計の制約から、発熱量が大きい高消費電力のGPUや、カードサイズの大きいGPUの搭載は推奨していません。
高いGPU性能を重視される場合は、十分なエアフローを確保できる、より大型筐体の採用が前提となります。

このような分野で活躍されている方へ

  • ゲノム解析
  • 分子生物学
  • 臨床検査
  • バイオインフォマティクス
  • 医療情報学

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
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MinION Mk1Dを最大限に生かすためのワークステーション構成支援
ストレージ選定のポイント
バイオインフォマティクス向け マシン選定のポイント お客様の声

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通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU Intel Core Ultra 7 265K 3.90GHz(8C/8T)+3.30GHz(12C/12T)
メモリ 合計32GB DDR5 6400 16GB x 2
ストレージ1 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA GeForce RTX5060Ti 16GB
ネットワーク 2.5Gbx1,Wi-Fi 7
筐体+電源 ミドルタワー型筐体+850W Cybenetics Gold
OS Ubuntu 24.04

キーワード

MinION Mk1Dとは

MinION Mk1Dは、Oxford Nanopore Technologies社が提供するポータブルなDNA/RNAシーケンサー。
リアルタイムで長鎖リードの取得が可能で、ゲノム解析、メタゲノム解析、トランスクリプトーム解析など幅広い分野に対応。USB接続で動作し、フィールドワークやラボでの迅速な遺伝子解析に最適。ナノポア技術により、従来のシーケンサーでは困難だった構造変異やエピジェネティクス解析にも対応可能。

参考:MinION Mk1D – Oxford Nanopore Technologies ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/12/15
事例No.PC-TS2J253959

細菌NGS解析向けワークステーション

用途:NGS解析 (SPAdes、Unicycler)MD計算 (GROMACS)
参考価格:995500

お客さまからのご相談内容

100万円程度の予算で、個人研究者向けのワークステーションを導入したい。
OSはUbuntu、ソフトはGromacs、Spades、Unicyclerを予定。
主な用途は細菌のNGS解析で、年に数回MD計算も実施。
メモリやストレージの拡張性を重視し、将来的なGPU増設にも対応できる構成を希望。

テガラからのご提案

本構成は、現在実施中の「ライフサイエンス研究開発向け特別キャンペーン」の特典(内蔵HDD 4TBストレージサービス)を適用した事例です。
ライフサイエンス研究開発向け特別キャンペーンの詳細はこちら

※本キャンペーンは終了しました
ライフサイエンス研究開発向け特別キャンペーンのご案内

CPUについて

SPAdesやGROMACSのマルチスレッド性能を最大限活かすため、予算内でできるだけ多くのコアを確保しました。
Xeon 6505P (12コア)を2基採用し、合計24コア構成とすることで、並列処理に強い環境を実現しています。

メモリについて

メモリは128GB(16GB×8枚)を実装。
空きスロットを利用して増設すれば最大256GB、上位規格のメモリに換装すれば、更に容量を増やす事も可能です。

ストレージ構成

高速アクセスのため4TBのM.2 SSDを組み込み、さらに大容量データ保存用に4TB HDDも追加しています。

GPUの選定と拡張性

現時点ではCPU解析を前提にオンボードGPU構成ですが、将来的なGROMACS用GPU増設に対応できる筐体を採用。
電源容量にも余裕を持たせ、アップグレードに柔軟に対応可能です。

このような分野で活躍されている方へ

  • バイオインフォマティクス
  • 分子動力学
  • ゲノム解析
  • ライフサイエンス
  • 計算化学

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。

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ストレージ選定のポイント
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主な仕様

CPU Intel Xeon 6505P 2.20GHz (TB3.0時 最大4.10GHz) 12C/24T x2基構成
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 16GB x 8
ストレージ1 4TB SSD M.2 NVMe Gen4
ストレージ2 4TB HDD S-ATA(ライフサイエンスキャンペーン特典1)
ビデオ on Board(VGA x1)
ネットワーク on board (10GbE x2)
筐体+電源 ミドルタワー型筐体+1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04

キーワード

SPAdesとは

SPAdesは、微生物やトランスクリプトーム解析向けのオープンソースアセンブラーです。
短鎖リード中心のハイブリッドアセンブリに対応し、細菌ゲノムドラフト作成やプラスミド解析、単一細胞解析などで広く利用されています。

参考:SPAdes Genome Assembler ※外部サイトに飛びます

Unicyclerとは

Unicyclerは、ショートリードとロングリードを組み合わせて細菌ゲノムやプラスミドの高精度アセンブリを実現するハイブリッドアセンブラーです。
SPAdesを内部利用しつつ自動でk-mer最適化やポリッシングを行い、少量のロングリードでも環状配列を完成させやすい点が特長です。

参考:Unicycler · GitHub ※外部サイトに飛びます

GROMACSとは

GROMACSは、数十万~数百万原子規模の分子動力学シミュレーションを高速に実行できるオープンソースソフトウェアです。
GPUやマルチコアCPUを活用した高度な並列計算に対応し、大規模かつ長時間の解析も効率的に行えます。

参考:GROMACS Official Website ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/12/5
事例No.PC-T52S254279

Cell Ranger対応バイオインフォマティクス用ワークステーション

用途:RNA-seq解析、Cell Ranger、R/RStudio
参考価格:1963500

お客さまからのご相談内容

PC-11781を見ての問い合わせ。
Cell Ranger を用いてシングルセルRNA-seq データ解析を、ローカルで実行可能な環境を導入したい。
解析規模は3万細胞×20サンプルで、これらを同時または順次処理を想定。

R/RStudioやSeuratなどの下流解析も快適に動作させたい。
予算は200万円以内で、ストレージはシステム用・データ用・バックアップ用をそれぞれ確保することを希望する。

参考:PC-11781 バイオインフォマティクス向けワークステーション

テガラからのご提案

CPUについて

Cell Rangerの並列処理性能を最大限に活かすため、32コア構成のXeon Gold 6530を2基搭載し、合計64コアの2CPUマシンとしました。

メモリ構成について

本構成では16GBメモリを16枚搭載し、各CPUのメモリチャンネルをすべて活用する設計としています。
総メモリ容量は256GBで、Cell Rangerの推奨要件を満たしています。
加えて、ご要望のRやSeuratなどの下流解析も快適にご利用いただけます。

ただし、解析規模や内容によっては、より大容量のメモリが推奨される場合があります。
今回の構成ではスロットがすべて埋まっているため、増設する際は容量の大きいモジュールへ交換が必要です。

参考:システム要件 _ 10x Genomics 公式サポート

ストレージについて

システム用に2TB M.2、解析で扱うデータの保存用に4TB M.2、バックアップ用途として外付け12TB HDDを追加し、データ保護を強化。
将来的なデータ増加に備え、NASや追加ストレージのご提案も可能です。

さらに今回は、ライフサイエンス研究者様応援キャンペーンのご利用で、10TB HDD を無償で1枚追加しております。
大規模なシングルセル解析では、サンプル数やデータ量が急速に増加します。
本キャンペーンは、追加費用なしでストレージを確保できる絶好の機会です。
キャンペーンの詳細は以下のリンクから

※本キャンペーンは終了しました

GPUについて

今回は、機械学習やGPUアクセラレータを考慮しないため、画面描画用としてエントリークラスの RTX A400 を採用しました。

このような分野で活躍されている方へ

  • ゲノム解析
  • バイオインフォマティクス
  • 分子生物学
  • 免疫学
  • 医薬学研究

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。

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主な仕様

CPU Intel Xeon Gold 6530 2.10GHz(TB 4.00GHz) 32C/64T ×2基構成
メモリ 合計256GB DDR5 5600 REG ECC 16GB x 16
ストレージ1 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ストレージ2 4TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x4)
ネットワーク on board (10GBase-T x2)
筐体+電源 タワー型筐体+1500W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit
ストレージ3 外付けHDD 1ドライブモデル 12TB (RAIDなし)
ストレージ4 10TB HDD S-ATA (ライフサイエンスキャンペーン)
その他 ライフサイエンスキャンペーン ストレージサービス

キーワード

Cell Rangerとは

Cell Rangerは、10x GenomicsのChromiumプラットフォームで得られる単一細胞RNAシーケンスデータを、一括で解析できるソフトです。
リードのマッピングから細胞×遺伝子マトリクス作成、クラスタリングまで自動化され、専門的なバイオインフォマティクス知識がなくても高品質な前処理や標準解析が可能です。大学や研究機関、製薬企業の研究者が、細胞多様性解析や細胞型同定、免疫レパートリー解析に広く利用しています。

参考:Cell Ranger | Official 10x Genomics Support ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/11/27
事例No.PC-TS1J254124

分子構造解析用ワークステーション

用途:AmberやRを用いた分子構造解析
参考価格:1899700

お客さまからのご相談内容

分子構造解析に使用するCPUマシンの導入を検討している。
AmberやRを使用する予定。
3年保証付きで、ラックへの設置を含めて見積もりしてほしい。
具体的なスペックとして、CPUはXeon Gold 5512U、メモリはDDR5-5600 ECC R-DIMM 16GB×4、ストレージは480GB SSD×2、OSはUbuntu 22.04 LTSを考えている。
また、将来的にSSDを追加してRAIDを組めるように、RAIDカードの搭載も希望する。

テガラからのご提案

CPUについて

お客様の用途に合わせ、最新の第6世代Xeonプロセッサ「Intel Xeon 6731P (32コア/64スレッド) 」を採用しました。
高い並列処理性能により、AmberやRなどの分子解析・統計解析ソフトで、高い処理性能を発揮します。

メモリ構成について

DDR5-6400 REG ECCメモリを64GB (16GB×4) 搭載しています。
高速かつ信頼性の高いメモリにより、解析処理の安定性を確保しています。

ストレージとRAID構成について

480GB SSD (SATA) を2枚搭載し、RAIDカードを実装しています。
初期出荷状態では「RAID構成なし」としていますが、将来的なRAID構築が可能な構成です。

筐体サイズと拡張性について

筐体前面・後面のベイからストレージを交換・増設できる2Uラックマウント筐体を採用しました。
将来的なストレージ増設にも対応できる拡張性を備えています。

OSと保証について

Ubuntu 22.04 LTSをプリインストールし、3年間のセンドバック保証を付帯。
現地設置 (開梱・ラック設置・起動確認) を含めたご提案ですので、導入後すぐに運用可能です。

このような分野で活躍されている方へ

  • 分子動力学
  • 統計解析
  • バイオインフォマティクス
  • 医学
  • 生物学

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主な仕様

CPU Intel Xeon 6731P 2.50GHz (TB最大4.10GHz) 32C/64T
メモリ 合計64GB DDR5 6400 REG ECC 16GB x 4
ストレージ 480GB SSD S-ATA x2
ビデオ on Board (VGA x1)
ネットワーク on board (1GbEx1,10GbEx1)
筐体+電源 2Uラックマウントシャーシ + 1200W リダンダント電源
OS Ubuntu 22.04
その他 3年センドバック保証
ラックマウント用 スライドレール
SAS/SATA対応 RAIDカード
現地設置 (開梱・ラッキング・ケーブリング・起動確認)

キーワード

・Amberとは
Amberは、分子動力学(MD)シミュレーションを高精度かつ高速に実行できる計算化学ソフトウェアです。
GPUアクセラレーションに対応しており、大規模な生体分子系の長時間シミュレーションを効率的に実行できます。タンパク質、核酸、脂質などの構造解析や自由エネルギー計算に広く利用されており、CUDA対応GPUによる並列計算によって、従来のCPUベース計算に比べて劇的な高速化を実現しています。

参考:Amber GPU Performance Benchmarks – ambermd.org

事例追加日:2025/10/29
事例No.PC-TW3J254117

AlphaFold3用ワークステーション

用途:Alphafold3を用いたタンパク質構造予測解析
参考価格:4016100

お客さまからのご相談内容

Alphafold3を用いた構造予測解析に対応するGPUマシンの導入を検討している。
他にもAmberやRを使用する予定。
具体的なスペックとして、Xeon W7-3545、RTX PRO 5000、DDR5-5600 ECC R-DIMM 32GB×8のメモリ構成、ストレージには480GB SSD×2と15.36TBU.2 NVMe Gen5 SSD×1を希望する。
Ubuntu 24.04環境での安定動作を重視し、3年保証、ラックへの設置までを含んだ見積もりが欲しい。
また、将来的なRAID対応やSSD追加に対応できる構成にしてほしい。

テガラからのご提案

CPUとメモリ構成について

お客様のご指定どおり,24コア48スレッドのXeon W7-3545を搭載しております。
メモリは合計256GB (32GB×8) を搭載し、大規模な分子動力学計算や機械学習処理にも十分な容量を確保しています。

GPUの選定について

ご希望のRTX PRO 5000 48GBを搭載し、Alphafold3の推論処理やCUDAベースの解析に最適化された構成です。
将来的なGPU追加にも対応できるよう、PCIe x16スロットを6本備えた拡張性の高いマザーボードを選定しています。
なお、将来的にGPUを追加される場合は、電源やRAIDカードの調整等が必要となるため、計画段階でご相談いただくことをおすすめします。

ストレージとRAID対応について

480GB SATA SSDに加え、15.36TBのU.2 NVMe Gen5 SSDを搭載。
高速なデータアクセスが求められる解析用途に対応しつつ、RAID構成の柔軟性も確保しています。
SAS/SATA対応のRAIDカードを搭載しており、将来的なRAID構成変更やSSD追加にも対応可能です。

ケース・電源・設置対応について

タワー・4Uラックマウントどちらにも対応可能な筐体を採用し、GPUや拡張カードの冷却・設置性を確保。
1500Wの80PLUS PLATINUM電源を搭載し、安定した電力供給を実現しています。
現地設置 (開梱・ラック設置・起動確認) まで対応可能で、3年センドバック保証もお付けしています。

ソフトウェア環境について

AlphaFold 3のGPU環境構築をスムーズに行えるよう、CUDA Toolkitをあらかじめプリインストールしています。

また、ご要望に応じてAmberやRなどの分子解析・統計解析ソフトウェアもプリインストールした状態でご提供可能です。

このような分野で活躍されている方へ

  • 分子動力学
  • 統計解析
  • バイオインフォマティクス
  • 医学
  • 生物学

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主な仕様

CPU Intel Xeon W7-3545 2.70GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 24C/48T
メモリ 合計256GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 8
ストレージ1 480GB SSD S-ATA x2
ストレージ2 15.36TB SSD U.2 NVMe Gen5
ビデオ NVIDIA RTX PRO5000 48GB
ネットワーク on board (1GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 GPGPU用 4Uラックマウントシャーシ + 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04
その他 3年センドバック保証
CUDA Toolkit インストール
ラックマウント用 スライドレール
SAS/SATA対応 RAIDカード
現地設置 (開梱・ラッキング・ケーブリング・起動確認)

キーワード

・AlphaFoldとは
AlphaFoldは、DeepMindが開発した革新的なタンパク質構造予測AI。アミノ酸配列から高精度な立体構造を予測することが可能で、従来の実験的手法 (X線結晶構造解析やNMR) に比べて圧倒的なスピードとコスト効率を実現。構造生物学、創薬、酵素設計、疾患研究など幅広い分野で活用されており、AlphaFold Protein Structure Databaseを通じて数百万の構造情報が公開されている。

参考:AlphaFold – DeepMind

・Amberとは
Amberは、分子動力学(MD)シミュレーションを高精度かつ高速に実行できる計算化学ソフトウェアです。
GPUアクセラレーションに対応しており、大規模な生体分子系の長時間シミュレーションを効率的に実行できます。タンパク質、核酸、脂質などの構造解析や自由エネルギー計算に広く利用されており、CUDA対応GPUによる並列計算によって、従来のCPUベース計算に比べて劇的な高速化を実現しています。

参考:Amber GPU Performance Benchmarks – ambermd.org

事例追加日:2025/10/29
事例No.PC-TUKS254328

MinION Mk1D用ワークステーション

用途:ナノポアシーケンシング解析 (MinION Mk1D)
参考価格:982300

お客さまからのご相談内容

Oxford Nanopore Technologies社のMinION Mk1Dによるナノポアシーケンシング解析を予定している。
具体的な解析内容は未定だが、まずは予算申請用として見積もりを取得したい。

テガラからのご提案

MinION Mk1Dに最適化した構成

MinION Mk1Dの公式要件に準拠し、USB Type-C接続やUbuntu 24.04対応など、シーケンシング環境に必要な条件を満たす構成としました。
Thunderbolt4やUSB 10Gbpsなどの高速I/Oに対応し、外部デバイスとの接続性も確保しています。
MinKNOWによるリアルタイム制御やデータストリーミングにも対応できるよう、CPU・メモリ・ストレージを強化しました。

参考:MinION Mk1D IT requirements | Oxford Nanopore Technologies

CPUとメモリについて

CPUには20コア構成のIntel Core Ultra 7 265Kを採用しており、解析処理やデータ転送などの高負荷な作業にも十分対応できます。
メモリは64GBを搭載。MinKNOWの推奨要件である32GBを上回るメモリ容量を確保することで、解析処理の安定性を確保しています。

GPUの選定について

NVIDIA GeForce RTX 5090 (32GB) を搭載し、将来的な機械学習やベースコーリング処理にも対応可能な、高性能GPUを選定しました。

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  • 医学
  • 生物学
  • ゲノム解析
  • 次世代シーケンサー解析

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各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
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MinION Mk1Dを最大限に生かすためのワークステーション構成支援
ストレージ選定のポイント
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主な仕様

CPU Intel Core Ultra 7 265K 3.90GHz (8C/8T) +3.30GHz (12C/12T)
メモリ 合計64GB DDR5 6400 32GB x 2
ストレージ 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA GeForce RTX5090 32GB
ネットワーク 2.5Gbx1,Wi-Fi 7
筐体+電源 ミドルタワー筐体 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04

キーワード

・MinION Mk1Dとは
MinION Mk1Dは、Oxford Nanopore Technologies社が提供するポータブルなDNA/RNAシーケンサー。リアルタイムで長鎖リードの取得が可能で、ゲノム解析、メタゲノム解析、トランスクリプトーム解析など幅広い分野に対応。USB接続で動作し、フィールドワークやラボでの迅速な遺伝子解析に最適。ナノポア技術により、従来のシーケンサーでは困難だった構造変異やエピジェネティクス解析にも対応可能。

参考:MinION Mk1D – Oxford Nanopore Technologies

・MinKNOWとは
MinKNOWは、Oxford Nanopore Technologies社のDNA/RNAシーケンサーを制御・解析するための公式ソフトウェア。
サンプルのロードからリアルタイムのデータ取得、品質評価、基本的な解析までを一括して行えるため、生命科学や微生物学、がん研究など幅広い分野の大学や企業の研究者に活用されている。シーケンスの進行状況をリアルタイムで可視化しながら実験条件を柔軟に調整できる点が大きな特徴。

参考:MinION Mk1D – Oxford Nanopore Technologies

事例追加日:2025/10/24

ご注文の流れ

お問い合わせフォームよりご相談内容をお書き添えの上、 お問い合わせください。
(お電話でもご相談を承っております)
弊社より24時間以内にメールにてご連絡します。
必要に応じてメールにて打ち合わせさせていただいた上で、 メール添付にてお見積書をお送りします。
お見積もり内容にご納得いただけましたら、メールにてご注文ください。
ご注文確定後、必要な部材を手配し PCを組み立てます。
(掛売りの場合、最初に新規取引票のご記入をお願いしております)
動作チェックなどを行い、納期が確定いたしましたらご連絡いたします。
(納期は仕様や製造ラインの状況により異なります)
お客様のお手元にお届けいたします (ヤマト運輸/西濃運輸)

お支払い方法

お支払い方法は、お見積もりメール・お見積書でもご案内しています。

法人掛売りのお客様
原則として、月末締、翌月末日払いの後払いとなります。
学校、公共機関、独立行政法人のお客様
納入と同時に書類三点セット(見積書、納品書、請求書)をお送りしますのでご請求金額を弊社銀行口座へ期日までにお振込み願います。
先に書面での正式見積書(社印、代表者印付)が必要な場合はお知らせください。
企業のお客様
納品時に、代表者印つきの正式書類(納品書、請求書)を添付いたします。
ご検収後、請求金額を弊社銀行口座へお支払い期日までにお振込み願います。
銀行振込(先振込み)のお客様
ご注文のご連絡をいただいた後、お振込みを確認した時点で注文の確定とさせていただきます。

修理のご依頼・サポートについて

弊社製PCの保証内容は、お見積もりメールでもご案内しています。

■お問合せ先
テガラの取り扱い製品に関する総合サポート受付のWEBサイトをご用意しております。
テガラ株式会社 サポートサイト

※お問い合わせの際には、「ご購入前」と「ご購入後」で受付フォームが分かれておりますので、ご注意ください。

メール support@tegara.com
電話 053-543-6688

■テグシスのサポートについて
保証期間内の修理について

保証期間内におけるハードウェアの故障や不具合につきましては、無償で修理いたします。
ただし、お客様による破損や、ソフトウェアに起因するトラブルなど保証規定にて定める項目に該当する場合は保証対象外となります。
保証期間経過後も、PCをお預かりしての初期診断は無料で実施しております。

無料メール相談
PCの運用やトラブルにつきまして、メールでのご相談を承ります。経験・知識の豊富な技術コンサルタントが無料でアドバイスいたします。
※調査や検証が必要な場合はお答えできなかったり、有償対応となることがあります

オプション保証サービス

「あんしん+」 もしもの時の延長保証サービス

PCのご購入時にトータル5年までの延長保証をご選択いただけます。また、ご購入後にも延長保証を申し込むことができます。
延長を申し込みいただきますと、標準保証と同等の保証を期間満了まで受けることができます。
なお、PCの仕様によっては料金が異なる場合があります。

延長保証あんしん+ ご加入のタイミング
※仕様によっては保証期間の延長ができない場合があります。

HDD返却不要サービス

保証期間内にPCのHDD(SSD)が故障した場合、通常、新品のHDDとの交換対応となり、故障したHDDはご返却いたしません。
しかしこの「HDD返却不要サービス」にご加入いただければ、保証期間内にHDD(SSD)が故障した場合には新品のHDDをご提供いたしますが、故障したHDDを引き渡していただく必要はありません。お客さまの大切なデータの入ったHDDをお手元に保管しておくことができます。

オンサイト保守サポート

故障発生時、必要に応じエンジニアスタッフが現地へ訪問し、保守対応を行うサービスです。
発送にかかる手間、時間を短縮できますので、緊急性の高い保守に最適です。

費用ご参考(目安)
本体+延長保証代金の10%~
※ 製品の性質や価格帯、条件等により異なります。
★TEGSYS オンサイト保守利用規約はこちら (pdf)
お客様のご要望をうかがい、最適なPCの構成をご提案する
「お客様だけのオーダーメイドPC」を製作しています。
用途に応じた細かなアドバイスや迅速な対応がテガラの強みです。

上記の仕様はテガラでお客様に提案したPC構成の一例です。
掲載内容は提案当時のものであり、また使用する部材の供給状況によっては、現在では提供がむずかしいものや、部材を変更してのご提案となる場合がございます。

参考価格については、提案当時の価格(送料込・税込)になります。
ご相談時期によっては価格が異なる場合がございますので、あらかじめご了承ください。