- 事例No.PC-TS1J254124
-
分子構造解析用ワークステーション
用途：AmberやRを用いた分子構造解析参考価格：1899700円お客さまからのご相談内容
分子構造解析に使用するCPUマシンの導入を検討している。
AmberやRを使用する予定。
3年保証付きで、ラックへの設置を含めて見積もりしてほしい。
具体的なスペックとして、CPUはXeon Gold 5512U、メモリはDDR5-5600 ECC R-DIMM 16GB×4、ストレージは480GB SSD×2、OSはUbuntu 22.04 LTSを考えている。
また、将来的にSSDを追加してRAIDを組めるように、RAIDカードの搭載も希望する。テガラからのご提案
CPUについて
お客様の用途に合わせ、最新の第6世代Xeonプロセッサ「Intel Xeon 6731P (32コア/64スレッド) 」を採用しました。
高い並列処理性能により、AmberやRなどの分子解析・統計解析ソフトで、高い処理性能を発揮します。メモリ構成について
DDR5-6400 REG ECCメモリを64GB (16GB×4) 搭載しています。
高速かつ信頼性の高いメモリにより、解析処理の安定性を確保しています。ストレージとRAID構成について
480GB SSD (SATA) を2枚搭載し、RAIDカードを実装しています。
初期出荷状態では「RAID構成なし」としていますが、将来的なRAID構築が可能な構成です。筐体サイズと拡張性について
筐体前面・後面のベイからストレージを交換・増設できる2Uラックマウント筐体を採用しました。
将来的なストレージ増設にも対応できる拡張性を備えています。OSと保証について
Ubuntu 22.04 LTSをプリインストールし、3年間のセンドバック保証を付帯。
現地設置 (開梱・ラック設置・起動確認) を含めたご提案ですので、導入後すぐに運用可能です。このような分野で活躍されている方へ
- 分子動力学
- 統計解析
- バイオインフォマティクス
- 医学
- 生物学
テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。
通常24時間以内に担当者からご連絡いたします
主な仕様
CPU Intel Xeon 6731P 2.50GHz (TB最大4.10GHz) 32C/64T メモリ 合計64GB DDR5 6400 REG ECC 16GB x 4 ストレージ 480GB SSD S-ATA x2 ビデオ on Board (VGA x1) ネットワーク on board (1GbEｘ1，10GbEｘ1) 筐体+電源 2Uラックマウントシャーシ ＋ 1200W リダンダント電源 OS Ubuntu 22.04 その他 3年センドバック保証
ラックマウント用 スライドレール
SAS/SATA対応 RAIDカード
現地設置 (開梱・ラッキング・ケーブリング・起動確認)キーワード
・Amberとは
Amberは、分子動力学(MD)シミュレーションを高精度かつ高速に実行できる計算化学ソフトウェアです。
GPUアクセラレーションに対応しており、大規模な生体分子系の長時間シミュレーションを効率的に実行できます。タンパク質、核酸、脂質などの構造解析や自由エネルギー計算に広く利用されており、CUDA対応GPUによる並列計算によって、従来のCPUベース計算に比べて劇的な高速化を実現しています。事例追加日：2025/10/29
- 事例No.PC-TW3J254117
-
AlphaFold3用ワークステーション
用途：Alphafold3を用いたタンパク質構造予測解析参考価格：4016100円お客さまからのご相談内容
Alphafold3を用いた構造予測解析に対応するGPUマシンの導入を検討している。
他にもAmberやRを使用する予定。
具体的なスペックとして、Xeon W7-3545、RTX PRO 5000、DDR5-5600 ECC R-DIMM 32GB×8のメモリ構成、ストレージには480GB SSD×2と15.36TBU.2 NVMe Gen5 SSD×1を希望する。
Ubuntu 24.04環境での安定動作を重視し、3年保証、ラックへの設置までを含んだ見積もりが欲しい。
また、将来的なRAID対応やSSD追加に対応できる構成にしてほしい。テガラからのご提案
CPUとメモリ構成について
お客様のご指定どおり，24コア48スレッドのXeon W7-3545を搭載しております。
メモリは合計256GB (32GB×8) を搭載し、大規模な分子動力学計算や機械学習処理にも十分な容量を確保しています。GPUの選定について
ご希望のRTX PRO 5000 48GBを搭載し、Alphafold3の推論処理やCUDAベースの解析に最適化された構成です。
将来的なGPU追加にも対応できるよう、PCIe x16スロットを6本備えた拡張性の高いマザーボードを選定しています。
なお、将来的にGPUを追加される場合は、電源やRAIDカードの調整等が必要となるため、計画段階でご相談いただくことをおすすめします。ストレージとRAID対応について
480GB SATA SSDに加え、15.36TBのU.2 NVMe Gen5 SSDを搭載。
高速なデータアクセスが求められる解析用途に対応しつつ、RAID構成の柔軟性も確保しています。
SAS/SATA対応のRAIDカードを搭載しており、将来的なRAID構成変更やSSD追加にも対応可能です。ケース・電源・設置対応について
タワー・4Uラックマウントどちらにも対応可能な筐体を採用し、GPUや拡張カードの冷却・設置性を確保。
1500Wの80PLUS PLATINUM電源を搭載し、安定した電力供給を実現しています。
現地設置 (開梱・ラック設置・起動確認) まで対応可能で、3年センドバック保証もお付けしています。ソフトウェア環境について
AlphaFold 3のGPU環境構築をスムーズに行えるよう、CUDA Toolkitをあらかじめプリインストールしています。
また、ご要望に応じてAmberやRなどの分子解析・統計解析ソフトウェアもプリインストールした状態でご提供可能です。このような分野で活躍されている方へ
- 分子動力学
- 統計解析
- バイオインフォマティクス
- 医学
- 生物学
テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。通常24時間以内に担当者からご連絡いたします
主な仕様
CPU Intel Xeon W7-3545 2.70GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 24C/48T メモリ 合計256GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 8 ストレージ1 480GB SSD S-ATA x2 ストレージ2 15.36TB SSD U.2 NVMe Gen5 ビデオ NVIDIA RTX PRO5000 48GB ネットワーク on board (1GbE x1 /10GbE x1) 筐体+電源 GPGPU用 4Uラックマウントシャーシ ＋ 1500W 80PLUS PLATINUM OS Ubuntu 24.04 その他 3年センドバック保証
CUDA Toolkit インストール
ラックマウント用 スライドレール
SAS/SATA対応 RAIDカード
現地設置 (開梱・ラッキング・ケーブリング・起動確認)キーワード
・AlphaFoldとは
AlphaFoldは、DeepMindが開発した革新的なタンパク質構造予測AI。アミノ酸配列から高精度な立体構造を予測することが可能で、従来の実験的手法 (X線結晶構造解析やNMR) に比べて圧倒的なスピードとコスト効率を実現。構造生物学、創薬、酵素設計、疾患研究など幅広い分野で活用されており、AlphaFold Protein Structure Databaseを通じて数百万の構造情報が公開されている。・Amberとは
Amberは、分子動力学(MD)シミュレーションを高精度かつ高速に実行できる計算化学ソフトウェアです。
GPUアクセラレーションに対応しており、大規模な生体分子系の長時間シミュレーションを効率的に実行できます。タンパク質、核酸、脂質などの構造解析や自由エネルギー計算に広く利用されており、CUDA対応GPUによる並列計算によって、従来のCPUベース計算に比べて劇的な高速化を実現しています。事例追加日：2025/10/29
- 事例No.PC-TRNJ253648
-
Autodock Vina・GROMACS用ワークステーション
用途：Autodock Vina、GROMACS参考価格：592900円お客さまからのご相談内容
Autodock Vina (または vina-gpu) と、 GROMACS を用いた分子シミュレーションに使用するPCを導入したい。
OSはUbuntuを希望。
CPUはIntel Core 構成を中心に検討中だが、AMD Ryzen構成も選択肢に含む。
メモリ容量は32GBを基本とし、64GBへの増設による性能向上の程度を確認したい。テガラからのご提案
CPUについて
今回の構成では、AMD Ryzen 9 9950X3Dを採用しました。
GROMACSはCPUのL3キャッシュを多用するため、キャッシュ容量が処理性能に大きく影響します。
Ryzen 9 9950X3Dは128MBのL3キャッシュを搭載し、OpenBenchmarking.orgのGROMACSベンチマークでは高い処理性能を記録しています。そのため、分子シミュレーション用途における計算効率の最大化を目的として、本構成に採用しました。
一方で、既存の運用環境との親和性やコストの観点などから Intel Core Ultraシリーズをご希望の場合には、そちらをベースとした構成もご提案可能です。
用途やご要望に応じて、最適な環境をご案内いたします。GPUの選定について
GPUにはNVIDIA GeForce RTX 5070を選定しています。
使用予定のソフトウェアであるvina-gpuとGROMACSは、CUDA対応GPUによる計算加速に対応しており、RTX 5070はその要件を満たしています。
Ubuntu環境での安定動作も確認されているため、GPUアクセラレーションを活用する構成に適しています。メモリの増設について
本構成は32GBメモリを搭載していますが、用途や状況によっては64GBへの増設が効果的です。
以下のようなケースでは、増設により処理性能や安定性の向上が期待できます。・32GB環境でメモリ不足からスワップが発生し、処理が遅くなっている場合
・Autodock VinaやGROMACSの複数ジョブを同時に動かしている場合
・メモリ不足のため計算を分割して実行している場合これらのケースでは、64GBへの増設により処理速度や安定性が向上し、本来の性能を引き出すためのボトルネック解消策として効果が期待できます。
ただし、64GBに増設することで必ず解決するとは限りません。
実際の計算に必要なメモリ容量は、使用するソフトウェアやデータサイズ、並列実行数によって大きく異なります。
導入前には、現在のご使用状況やメモリ消費量の確認をおすすめします。
ご不明点や具体的な構成のご相談は、ぜひテガラまでお気軽にお問い合わせください。このような分野で活躍されている方へ
- 創薬研究
- 計算化学
- 分子生物学
- 薬理学
- バイオインフォマティクス
テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。
通常24時間以内に担当者からご連絡いたします
主な仕様
CPU AMD Ryzen9 9950X3D 4.30GHz(Boost時最大5.70GHz) 16C/32T メモリ 合計32GB DDR5 5600 16GB x 2 ストレージ1 1TB SSD S-ATA ビデオ NVIDIA GeForce RTX5070 12GB ネットワーク on board(2.5G x1) Wi-Fi，Bluetooth 筐体+電源 ミドルタワー型筐体＋1000W 80PLUS PLATINUM OS Ubuntu 24.04 キーワード
Autodock Vinaとは
AutoDock Vinaは、分子ドッキングとバーチャルスクリーニングに特化したオープンソースソフトウェアで、創薬や構造生物学の研究者に広く利用されています。
高速・高精度な計算を実現する最適化アルゴリズムに加え、マルチスレッド対応やシンプルな操作性も特長的です。
オープンソースソフトウェアのため、コストをかけずに自由に使うことが出来、企業・大学問わず多様な研究現場で活用が進んでいます。vina-gpuとは
vina-gpuは、Autodock VinaのGPU対応版として開発された、分子ドッキングをGPUの並列処理で高速化するソフトウェアです。
AutoDock Vinaと比べて最大65倍以上の高速化が可能で、大規模なバーチャルスクリーニングを効率的に実施できます。インストール不要のGUIも提供されており、専門知識がなくても直感的に操作できる点も特長です。GROMACSとは
GROMACSは、数十万～数百万原子規模の分子動力学シミュレーションを高速に実行できるオープンソースソフトウェアです。
GPUやマルチコアCPUを活用した高度な並列計算に対応し、大規模かつ長時間の解析も効率的に行えます。また、AMBERやCHARMMなど多様な力場をサポートし、幅広い分子系に柔軟に対応可能です。事例追加日：2025/10/1
- 事例No.PC-TRNJ253715
-
J-OCTA推奨スペック準拠ワークステーション (予算50万円以内)
用途：J-OCTA、分子シミュレーション参考価格：476300円お客さまからのご相談内容
J-OCTAを使用するPCを導入したい。
科研費スタート支援に採択されたため、テガラの若手研究者応援キャンペーンの特典A (マシン価格5%OFF) を適用し、50万円以内の予算で購入したい。
GPUよりもCPUに重視した設計で、OSはWindowsを希望する。テガラからのご提案
J-OCTAの推奨動作環境は下記の通りです。
・CPU: マルチコアCPU推奨
・メモリ: 16GB以上推奨
・グラフィックカード: OpenGLに対応したグラフィックカード (NVIDIA製を推奨)
・ハードディスク: 200GB以上の空き容量この要件を踏まえ、J-OCTAの利用に適した構成として、CPU性能を重視したワークステーションをご提案しています。
本構成は、現在実施中の「若手研究者応援キャンペーン (5%OFF)」を活用し、ご予算50万円以内で設計された事例です。※※研究スタートを応援する「若手研究者応援キャンペーン」の詳細はこちら▼※※
CPUについて
J-OCTAの並列計算処理に適した環境を構築するため、16コア32スレッドのRyzen 9 9950Xを採用しました。
分子動力学系ソフトウェアの長時間処理や複雑な演算にも耐える、実用的な計算性能を備えています。GPUについて
J-OCTAは主にCPUによる計算処理を行うソフトウェアで、GPUは描画補助としての役割にとどまります。
安定した描画性能を確保するため、OpenGL対応のNVIDIA RTX A400を選定しています。メモリとストレージについて
DDR5-5600 48GB×2 (計96GB) を搭載。空きスロットを活用することで、最大192GBまでのメモリ拡張が可能です。
ストレージには高速な1TB NVMe Gen4 SSDを採用し、J-OCTAの要件を満たす空き容量と十分な保存領域を確保しています。
将来的な処理負荷の増加にも対応できる、余裕を持った構成です。このような分野で活躍されている方へ
- 材料工学
- 分子動力学
- 計算化学
- 化学工学
- 物性物理
テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。通常24時間以内に担当者からご連絡いたします
主な仕様
CPU AMD Ryzen9 9950X 4.30GHz(Boost時最大5.70GHz) 16C/32T メモリ 合計96GB DDR5-5600 48GB x 2 ストレージ1 1TB SSD M.2 NVMe Gen4 ビデオ NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x4) ネットワーク on board(2.5GBase-T x1) Wi-Fi，Bluetooth 筐体+電源 ミドルタワー型筐体＋850W Cybenetics Gold OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit その他 TEGARA 若手研究者応援キャンペーン 特典A キーワード
J-OCTAとは
J-OCTAは、樹脂・ゴム・ナノコンポジットなど多様な材料や創薬分野を対象としたマルチスケールシミュレーションソフトウェアです。
原子スケールからマイクロメートルスケールまでの特性を予測できる、マルチスケール解析に対応しています。大学や企業の研究者が、材料設計や物性評価、メカニズム解析等の目的で幅広く活用しています。視覚的に優れたGUIや、複数スケール連携機能やデータサイエンス機能を備えており、実験だけでは得られにくい知見の発見や研究開発の効率化を後押しします。事例追加日：2025/9/26
- 事例No.PC-11762
-
分子動力学シミュレーション用マシン (64コアモデル)
用途：分子シミュレーション、分子動力学計算参考価格：2961200円お客さまからのご相談内容
これまで他社製のマシンを分子動力学シミュレーション用に使用していたが、故障等が多いためマシンの更新を検討している。
予算300万円程度で、上記の用途に適した構成を提案してほしい。現在使用しているマシンのスペックは以下の通り。CPU：Intel Xeon Gold 6242R (3.10GHz 20コア)
メモリ：192GB REG ECC
ストレージ：4TB HDD S-ATA
ビデオ：NVIDIA RTX A4500 20GB
OS： Windows 11 Pro for Workstations
保証期間：3年現在のマシンは、分子動力学シミュレーションで分子集合体のMD計算と一般的な解析に使用しており、機械学習での利用も考えている。また、MD計算のために夜通し連続稼働させることが多い。
今回導入を検討するマシンでは計算時間を短縮したいので、現在使用しているマシンよりも高性能なCPUを搭載したい。
加えて、VMDを用いての視覚的な分子集合系の確認や機械学習での使用も考えているため、最適なビデオカードが必要だと考えている。なお、量子化学計算は頻繁には行わないため、メモリは現行と同程度で充分だと考えている。
反対に、ストレージ容量はいまの4TBでは足りないため、20TB程度のHDDを希望する。テガラからのご提案
お客さまご希望の条件に沿った構成をご提案しました。
第4世代Xeon Scalableの2CPU構成
2024年3月時点で最新の第4世代Xeon Scalableシリーズを搭載したデュアルCPU構成です。
合計64のコア搭載数により、Intel Xeon Gold 6242Rと比較してもMD計算時のより高いパフォーマンスが期待できます。NVIDIA RTX A4500 20GBで機械学習は可能？
ビデオカードはご予算に合わせて、ご利用中のマシンと同じNVIDIA RTX A4500 20GBを選択しています。ご利用予定のソフトウェア「VMD」のシステム要件において、ビデオカードは“OpenGLでのハードウェアアクセラレーション可能なビデオカードを強く推奨”とのみ記載があります。NVIDIA RTX A4500 20GBはミドルレンジのワークステーション向け製品であり、OpenGL 4.6にも対応しているため、VMDの利用に十分なスペックを持っていると考えられます。
また、ビデオカードの性能はハードウェアアクセラレーションに対応したソフトウェアなど、一部の処理を除いて大きく影響しないのに対し、CPUのスペックは全体の処理性能に直結するため、GPUよりもCPUを重視した構成としています。今後DeepLearningなども行う場合、NVIDIA RTX A4500 20GBは推論用途には十分なパフォーマンスが期待できますが、学習用途にはスペックが不足してしまう可能性がありますのでご注意ください。また、本マシンの電源容量は現在の構成用に選定されているため、GPUの増設分などが考慮されていません。
GPUの増設など消費電力の大きい機器を増設する予定がある場合は、より大容量電源ユニットへの変更も可能ですのでお気軽にご相談ください。本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。
いただいた条件に合わせて柔軟にマシンをご提案いたしますので、掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。
通常24時間以内に担当者からご連絡いたします
主な仕様
CPU Intel Xeon Gold 6438Y+ (2.00GHz 32コア) x2 メモリ 256GB REG ECC ストレージ 20TB HDD S-ATA ビデオ NVIDIA RTX A4500 20GB ネットワーク on board (10GBase-T x2) 筐体+電源 タワー型筐体 + 1000W OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit その他 「あんしん+」3年引き取り修理保証 ■キーワード
・VMDとは
VMD (Visual Molecular Dynamics) は、イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校の理論・計算物理学グループによって開発されている分子モデリングソフトウェア。3Dグラフィックを用いて分子をモデリング・可視化・解析することができ、MacOS X、Unix、Windowsに対応している。
・DeepLearningとは
DeepLearningは機械学習の一種であり、多層のニューラルネットワークを用いて高度なパターン認識や予測を行う手法。一般的に大量のデータを必要とするため、データが豊富な場合に効果的な手法とされている。 また、DeepLeanigは画像認識や音声認識、自然言語処理などの分野で広く用いられている。複雑な特徴や関係性を学習することができるため、従来の機械学習手法よりも高い精度を発揮することができる。参考：【特集記事】機械学習ってなんだろう ※弊社オウンドメディア「TEGAKARI」に飛びます
事例追加日：2024/03/11
ご注文の流れ
 |
お問い合わせフォームよりご相談内容をお書き添えの上、 お問い合わせください。 （お電話でもご相談を承っております） |
 |
弊社より24時間以内にメールにてご連絡します。 |
 |
必要に応じてメールにて打ち合わせさせていただいた上で、 メール添付にてお見積書をお送りします。 |
 |
お見積もり内容にご納得いただけましたら、メールにてご注文ください。 ご注文確定後、必要な部材を手配し PCを組み立てます。 (掛売りの場合、最初に新規取引票のご記入をお願いしております) |
 |
動作チェックなどを行い、納期が確定いたしましたらご連絡いたします。 (納期は仕様や製造ラインの状況により異なります) |
 |
お客様のお手元にお届けいたします (ヤマト運輸/西濃運輸) |
お支払い方法
お支払い方法は、お見積もりメール・お見積書でもご案内しています。
| 法人掛売りのお客様 |
| 原則として、月末締、翌月末日払いの後払いとなります。 |
| 学校、公共機関、独立行政法人のお客様 |
| 納入と同時に書類三点セット（見積書、納品書、請求書）をお送りしますのでご請求金額を弊社銀行口座へ期日までにお振込み願います。 先に書面での正式見積書（社印、代表者印付）が必要な場合はお知らせください。 |
| 企業のお客様 |
| 納品時に、代表者印つきの正式書類（納品書、請求書）を添付いたします。 ご検収後、請求金額を弊社銀行口座へお支払い期日までにお振込み願います。 |
| 銀行振込(先振込み)のお客様 |
| ご注文のご連絡をいただいた後、お振込みを確認した時点で注文の確定とさせていただきます。 |
修理のご依頼・サポートについて
弊社製PCの保証内容は、お見積もりメールでもご案内しています。
■お問合せ先
テガラの取り扱い製品に関する総合サポート受付のWEBサイトをご用意しております。
テガラ株式会社 サポートサイト
※お問い合わせの際には、「ご購入前」と「ご購入後」で受付フォームが分かれておりますので、ご注意ください。
| メール | support@tegara.com |
| 電話 | 053-543-6688 |
■テグシスのサポートについて
保証期間内の修理について
保証期間内におけるハードウェアの故障や不具合につきましては、無償で修理いたします。
ただし、お客様による破損や、ソフトウェアに起因するトラブルなど保証規定にて定める項目に該当する場合は保証対象外となります。
保証期間経過後も、PCをお預かりしての初期診断は無料で実施しております。
無料メール相談
PCの運用やトラブルにつきまして、メールでのご相談を承ります。経験・知識の豊富な技術コンサルタントが無料でアドバイスいたします。
※調査や検証が必要な場合はお答えできなかったり、有償対応となることがあります
オプション保証サービス
| 「あんしん＋」 もしもの時の延長保証サービス |
|
PCのご購入時にトータル5年までの延長保証をご選択いただけます。また、ご購入後にも延長保証を申し込むことができます。
|
| HDD返却不要サービス |
|
保証期間内にPCのHDD(SSD)が故障した場合、通常、新品のHDDとの交換対応となり、故障したHDDはご返却いたしません。 
|
| オンサイト保守サポート | |
|
故障発生時、必要に応じエンジニアスタッフが現地へ訪問し、保守対応を行うサービスです。
|
「お客様だけのオーダーメイドPC」を製作しています。
用途に応じた細かなアドバイスや迅速な対応がテガラの強みです。
上記の仕様はテガラでお客様に提案したPC構成の一例です。
掲載内容は提案当時のものであり、また使用する部材の供給状況によっては、現在では提供がむずかしいものや、部材を変更してのご提案となる場合がございます。
参考価格については、提案当時の価格(送料込・税込)になります。
ご相談時期によっては価格が異なる場合がございますので、あらかじめご了承ください。
