ナノポアシーケンサー解析用マシンってどう選べばいいの？

こんなお悩みはありませんか？

テグシスなら大丈夫！

ナノポアシーケンサー解析と相性の良い用途

ナノポアシーケンサー解析ではGPU計算を行う場合が多いため、PC構成の選定ではGPUのスペックを重視する傾向にあります。ベースコール用途ではハイエンドモデルのGPUであるNVIDIA 6000 Adaが推奨される場面が多く、マシン自体も高額になりがちです。

ここでは、そんなGPUを重視するマシンと相性の良く、実際にお問合せいただくことの多い用途をご紹介します。性能・コストの両面で効率の良いマシン構成をご希望の際には必見です！

ナノポア ＋ 機械学習

機械学習はGPUをメインに使用されることが多く、ナノポア解析と相性の良い用途です。1台のマシンで機械学習、深層学習 (Deep Learning)とナノポア解析の両方を行うことができます。特に、ビデオメモリの多いGPUを搭載した構成がおすすめです。

【こんな事例があります】 ■事例No.PC-12146 シーケンス解析・DeepLearning用マシン 用途：WES (全エクソームシーケンス)解析、ロングリードシーケンス解析、DeepLeaning

ナノポア ＋ NGS解析

NGS解析用ソフトウェアの中には、GPU計算に対応しているものが複数存在します。それらのソフトウェアを使用する想定でGPU能力の高いマシンを導入する場合、NGS解析とナノポア解析の両方の用途での活躍が期待できます。

GPU計算に対応したNGS解析用ソフトウェアの例 (クリックで表示)

【こんな事例があります】 事例No.PC-10816 NGS解析&ナノポアシーケンサー解析用マシン 用途：MaSuRCAやGuppyを用いたハイブリッドアセンブリ、RNA-seq解析

ナノポア ＋タンパク質構造予測

AlphaFoldはTensorflowを用いたDeep Learningですので、上述のDeep Learningマシンと同様にナノポアシーケンサー解析用と相性の良い用途です。
扱うデータ量によっては、GPUスペックの他にストレージ容量もご検討いただくとよいかもしれません。

【こんな事例があります】 事例No.PC-10825 タンパク質結合解析用マシン 用途：タンパク質・低分子化合物の結合解析

よくあるご相談

CASE1：WSL2でUbuntu 24.04を利用したい
	WSL2上でUbuntuが利用できるように設定した状態での出荷も承っています。 ただし，Linux上で負荷の高い処理を行う場合は、OSをデュアルブート構成にして、ハードウェア上で直接Linuxを動作させる方が、計算パフォーマンス面でWSL2よりも優位です。 OS環境の構築はご相談に合わせた提案・設定を承っています。 例：WSL2/デュアルブートで計算を行うことがパフォーマンスに影響するか知りたい ■NVIDIA Geforce RTX4070 Super搭載 ナノポアシーケンサー解析用マシン 次世代シーケンサーによる16S rRNA解析およびRNA-seq解析用マシンのご提案事例です。 お客様はWSL2でUbuntuの利用を想定されており、計算パフォーマンスへの影響をご質問いただきました。
CASE2：予算内で、希望する性能を満たすナノポアシーケンサー解析用のマシンが欲しい
	テグシスでは、ご予算の範囲内でベストな構成をご提案いたします。 様々な要因により、すべての条件を同時に満たすことが難しいケースには、複数パターン構成をご提案して、理想的な研究環境づくりをお手伝いします。 例：ご予算の範囲内で、CPU/GPUの希望条件を満たすことが難しかった際のご提案 ■CPU優先：ナノポアシーケンサー解析用マシン (2CPU仕様) ■GPU優先：ナノポアシーケンサー解析用マシン (GPU性能優先) 予算内ではCPU・GPU性能を両立することができないため，CPU・GPU性能重視の構成案を検討 CPU等は変更が難しいため，将来的にGPUを増設する構成も可能です
CASE3：ナノポア以外にも、ソフトウェアを活用した解析を行いたい
	ご利用のソフトウェアに合わせて構成を検討いたします。 ソフトウェアごとに要求される要素が異なるケースは珍しくありません。CPUの並列処理能力が重要なソフトもあれば、メモリ容量の確保を重視すべきソフトもあったり、最近ではGPU計算機能の有無などもソフトウェアによってさまざまです。 そのため、テグシスではご利用のソフトウェアや重要性を総合的に判断し、ベストなご提案を心がけています。 例：ナノポアシーケンサー解析の他、DeepLearningを用いたソフトウェア「DeepVariant」も使いたい。 ■ナノポアシーケンサー解析用マシン (2023年05月版) 1台のマシンで解析とDeepLearningの両方を行いたい、というご相談に対応した例です。
CASE4：高額なPCのため、現地での設置や設定もお願いしたい。
	設置場所への直接搬入や、設置/設定サポートも承っています。 お気軽にお問い合わせください！ 例：現地設置を含めたお見積もりのご相談 ■シーケンス解析・DeepLeaning用マシン
CASE4：商社を経由した購入は可能でしょうか。
	商社様を経由したご提供も承っています。 また、商社様からご依頼いただいた場合には、仕様の検討や設置・設定などに関わる調整を、弊社とエンドユーザー様の間で直接行うことも可能です。 関連して、リース会社様を経由したご提供も多数の実績がございます。購入経路や手続きに関するご相談は、お気軽にお問い合わせください！ 取引先実績

1つでも当てはまったら… テグシスにご相談ください!! CASE1 既存マシンの性能が充分ではない   CASE2 ベストマッチなマシンスペックがわからない   CASE3 予算内で最も効率的なマシンを手に入れたい     計算処理に時間がかかると感じる場合は、PCの性能が処理内容に対して不足している可能性があります。「何となく遅い気がする」といったご相談も大丈夫です。   新たにPCを導入する際、適切なスペックを調査/検討するには時間がかかります。最適なハードウェアスペックが分からない場合も、専門スタッフが丁寧にサポートします。   テグシスはご予算に合わせてコストパフォーマンスの高いPC構成をご提案します。具体的なご予算が決まっていない場合や予算取りのためのお見積もりも大歓迎です。           CASE4 手続きに時間を取られたくない   CASE5 ソフトウェアの導入が面倒くさい   CASE6 設置の手間を省きたい     購入手続きに必要な書類やカタログの用意、ソフトウェア購入の申請手続き、調達に関わる様々な調整や対応は、ぜひご相談ください。   ソフトウェアをインストールした後も、実際に使える状態にするためのセットアップや環境づくりが必要な場合があります。そんな面倒な準備もテグシスが解決します。   開梱から配線、諸々の初期設定や梱包材、古いPCや周辺機器の廃棄など、設置や環境構築はテグシスにご相談ください。サーバー用ラックの導入も承っています。           CASE7 手持ちのパーツを活用したい   CASE8 購入後のフォロー体制が気になる   CASE9 技術的な打合わせを迅速に行いたい     お手持ちのパーツや、今使っているPCに搭載しているパーツの一部を使って新しいPCを導入したい場合など、適切な構成のご提案やパーツ取り付けをご相談ください。   テグシス製PCは、お預かりでの初期検証が無料！保証期間が終了したPCも、無料の初期検証を承っています。延長保証サービスも保証期間終了の1ヶ月後まで加入できます。   構成検討における前提条件や想定スペックや設置環境の実現可否、見積もり内容についての質問や要件変更に伴うプラン提示など素早く対応し、お客様をお待たせしません。

テグシスのPCはここがすごい

オーダーメイドのPC製作

テグシスでは、お客様のニーズに完全に応えるために、オーダーメイドのPC製作を提供しています。研究や開発の目的に応じて、最適なハードウェア構成をゼロから設計し、必要な性能を確実に引き出せるシステムを構築します。CPU、GPU、メモリ、ストレージといった各種コンポーネントを最適化し、特定の計算処理やアプリケーションに最適化されたPCを提供します。これにより、研究効率を最大限に高め、プロジェクトを迅速かつ正確に進めることが可能です。

素早い提案

お客様の要件を理解し、最適なソリューションを迅速に提案できるのがテグシスの強みです。ヒアリングから設計、提案までのプロセスを効率化し、お客様のプロジェクトの遅延を最小限に抑えます。例えば、急ぎの納期や特定の要件に対応するため、数日のうちにカスタム提案を行い、プロジェクトの進行をサポートします。スピードと品質を両立させたサービスを提供することで、研究開発のスムーズな進行を支えます。

柔軟なサポート体制

テグシスは、納品後もお客様を全面的にサポートします。導入後のトラブルシューティングやシステムのアップグレード、必要に応じた追加サポートなど、柔軟に対応できる体制を整えています。お客様が安心してPCを使用できるよう、遠隔サポートやオンサイトサポートなど、多様なサポートオプションを提供しています。また、研究環境の変化や新たなニーズにも柔軟に対応し、最適なアドバイスとサポートを行います。これにより、研究の進行がスムーズに行えるよう、常にバックアップを行っています。