バイオインフォマティクス解析最適なPCを紹介

Linux × Windows 共存運用

「解析はLinux、提出物や整理はWindows」

テガラなら、1台のワークステーションに Windows と Linux を安定共存させたデュアルブート環境を構築できます。
研究と業務を切り分けながら、両OSを安心して使える実践的な構成です。

以下の設計で、安定運用と保守性を両立します。

  • アップデートに強い安定したブート管理
  • 研究と業務をスムーズに切り分けられる構成

はじめに

ゲノム解析やRNA-seqなど、バイオインフォマティクスでは大量データを扱う計算処理が日常的です。解析はLinux前提のことが多い一方、報告書作成や資料共有などの業務ではWindowsも欠かせません。本稿では、1台のPCで両環境を共存させるデュアルブート構成をご紹介します。

なぜWindows環境が必要なのか

Windowsは、研究活動の「業務・管理側」を支えるOSとして多く利用されています。例えば、以下の用途です。

文書作成・社内ソフト

Officeや社内専用ソフトで、報告書・契約書の作成を短時間でまとめられる

社内インフラとの互換性

共有フォルダ、ドキュメント管理、プリンタ、社内専用アプリとの連携が安定

直感的な操作性

定型業務に強く、チーム全体で運用を揃えやすい(標準化)

現場でよくあるご要望:

Linux と Windows を併用したいという声は、研究現場でも一定のニーズがあります。
バイオインフォマティクス分野では、テグシスへのご相談でも「解析はLinuxで行い、成果整理や提出物作成はWindowsで行いたい」という運用を希望されるお客様が多く見られます。

テグシスのデュアルブート設計

安定したブート管理 ― 起動の主導権を Ubuntu 側に

一般的なデュアルブートでは、1台のSSDを分割して両OSを同じドライブに共存させる構成がよく見られます。
ただしこの方式は、システム更新のタイミングでブート領域が書き換わり、Windowsのアップデートによりブートローダーが上書きされて起動できなくなるケースが報告されています。

テグシスでは、このリスクを抑えるため、 Ubuntu 側のブートローダーで起動を管理する設計を採用します。

  • Ubuntu から Ubuntu / Windows を選択して起動(更新影響を受けにくい運用を意図)

デュアルブートの注意点(デメリット)

デュアルブートには多くのメリットがありますが、一般的な構成ではいくつか注意すべき点もあります。

注意点はこちら

  • OS切替えに時間がかかる:作業のたびに再起動が必要で、仮想環境に比べると手間がかかる場合があります(同時に両方の環境は使えません)
  • 設定やインストールがやや複雑:パーティション分割やブートローダー設定が必要
  • ブートローダー不具合リスク:初期設定やWindowsアップデートの影響で上書きされることがある

テグシスでは、これらの課題を踏まえ、SSD分離構成やUbuntu側ブート管理を標準仕様として採用しています。 物理的にストレージを分けることで、ブートローダーの安全性やセットアップの確実性が向上し、研究用途でも安心してご利用いただけます。

SSD分離構成による安定性と保全性 / 共有ストレージの活用

SSD分離構成(Windows / Linux 専用)

1台に両OSを入れる場合、同じストレージに配置すると更新や障害の影響が互いに及びやすくなります。 そこで、OSごとに専用SSDへ分けてインストールし、トラブル時の切り分けと復旧をしやすくします。

  • 一方のOSのトラブルが、もう一方へ波及しにくい
  • OS再インストールやアップグレードが容易
  • 誤操作やファイル破損のリスクを低減

共通のデータ領域(共有ストレージ)

WindowsとLinuxの両方から同じ解析データを扱いたい場合は、OS領域とは分離した共通のデータ領域(共有ストレージ)を用意する運用が実務的です(※共有ストレージをご希望の際は、事前にお知らせください)。 

  • OS切替えや再インストールの影響を受けにくい
  • バックアップや複製が行いやすい
  • 共同研究での受け渡しがスムーズ

例として、OS用SSDx2に加えて、データ保存用として3台目(HDD/SSD/NASなど)を用意し、両OSから参照できる形が挙げられます。

運用イメージ(共有ストレージを使う場合の例)

STEP1
解析(Linux)
STEP2
解析結果を共通のデータ領域(共有ストレージ)へ保存
STEP3
結果整理・提出物作成(Windows)

Linuxでの解析結果をすぐにWindows側で参照でき、作業の切り替えや共同作業がスムーズになります。

仮想環境との違い(WSL / 仮想マシンとの比較)

WSL(Windows Subsystem for Linux)や仮想マシンを利用してLinux環境を利用する方法もありますが、解析処理ではネイティブ環境の方が安定かつ高速に動作するケースが多く見られます。

  • CPUやメモリ資源を解析処理に最大限活用可能
  • GPU計算時のドライバやCUDA環境が安定
  • OSが直接ハードウェアを制御するため、入出力処理が安定
項目 デュアルブート構成 WSL / 仮想マシン
計算性能 ネイティブ性能を発揮 仮想化のオーバーヘッドあり
GPU利用 ドライバ・CUDAが安定動作 制限・互換性問題あり
リソース利用 CPU/メモリを100%活用可能 分割・制限が発生
入出力処理 OSが直接制御し安定 仮想層経由で遅延


WSL2の動作や注意点の理解を深めたい方へ、以下の技術解説も参考になります。

おわりに

LinuxとWindowsを1台で使い分けるデュアルブートは、計算性能と業務効率を両立できる、柔軟で信頼性の高い運用方法です。
テグシスでは、SSD分離・Ubuntu 側の起動管理・共有ストレージ設計を組み合わせ、解析に集中できる環境をご提案します。