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事例No.PC-10260B
参考価格：
645,700円

タンパク質立体構造解析用マシン (Xeon構成)

用途：AlphaFold2

お客さまからのご相談内容

タンパク質の立体構造を解析するツール「AlphaFold2」を使用するためのマシンを検討したい。
事例No.PC-9327と同程度のマシンを考えている。

テガラからのご提案

PC-9327の構成は一部パーツが終息しているため、ほぼ同一のアーキテクチャーを採用するXeon W-2200シリーズを採用した仕様で検討しました。

AlphaFold2の計算処理は、GPU性能の影響を受ける部分がかなり大きいことや、約2.7TBのデータベースに計算中も頻繁にアクセスするため、データベースを格納するストレージデバイスの性能が使用感に大きく影響します。
本構成ではコストを優先する方針で、データベース用のストレージを4TBのHDDとしていますが、速度重視の場合には事例No.PC-10260Aをご検討ください。

主な仕様

CPU Xeon W-2255 (3.70GHz 10コア)
メモリ 64GB
ストレージ1 500GB SSD S-ATA
ストレージ2 4TB HDD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX A4000
ネットワーク on board (10/100/1000Base-T x1 5G x1)
筐体+電源 ミドルタワー筐体 + 850W
OS Ubuntu 20.04
その他 CUDA Toolkit 11インストール
バイオインフォマティクス特定ソフトウェア動作最適化GPGPUワークステーション1CPUIntel Xeon64GB・96GB 構成NVIDIA RTXLinux～100万円

検索キーワード
G protein-coupled receptors,AlphaFold2,protein structure prediction,structural biology

事例追加日：2022/09/13
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