PC提案事例

事例No.PC-7673Aを見ての問い合わせ。メタゲノム解析用のマシンの導入を検討している。
隠れマルコフモデルを使用したバイオシーケンス分析を行うソフトウェア HMMER を、高速で動かすことのできるマシンを提案して欲しい。
想定しているスペック・条件は以下の通り。

・CPU： x86系
・メモリ： 128GB以上
・SSD： 2TB 以上
・HDD ： 10TB 以上
・OS： Ubuntu
・予算： 100万円程度

事例No.PC-7673Aの構成を踏まえつつ、ご予算と指定の要件に合わせて改めて検討しました。

OSは現時点で正式にリリースされている最新のLTSとして、Ubuntu 20.04を選択しています。
また、CPUにはPC-7673Aよりも新しい第3世代 Xeon Scalableを選択しています。
CPUのモデルやその他のスペックは、ご予算に合わせた暫定での構成として選択しています。お客様ごとのご要望・条件に合わせて検討しますので、お気軽にご相談ください。

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事例No.PC-5346を見ての問い合わせ。
次世代シーケンサー解析 (NGS) 用ソフト「CLC Genomics Workbench」の利用にあわせたマシンが欲しい。予算は100万円～150万円程度を想定。
大まかな希望スペックは以下の通り。できるだけメモリ容量の多い構成を希望する。

・CPU：16～32コア
・メモリ：128～256GB
・OS：Linux

ご覧いただいたPC-5346を、最新世代にアップデートしたスペックでご提案しました。
CPUやメモリ容量は、お客様のご要望を踏まえての検討としています。
PC-5346と比較して、CPUのグレード差・世代差などにより、処理性能が大きく向上しています。
また、OSはCLC Genomics WorkBenchが対応するRHEL相当のCentOSとしました。

PC-5346と異なり、本事例にはディスプレイを含めていませんので、ご希望の際にはお申し付けください。

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事例No.PC-6601を現行スペックに直した見積もりが欲しい。
シングルセルRNA-Seq解析用マシンとしての利用を想定しており、メモリは128GB以上でCPUコア数も12コア以上を希望する。
予算は、100万円以下の場合と100万円～150万円の場合で提案して欲しい。

PC-6601は旧世代の構成ですので、ご要望に合わせて現行スペックにアップデートした内容でご提案しました。
本構成はご予算150万円想定でのご提案ですが、ご予算100万円以下想定で、CPUのモデルが異なる事例No.PC-9379Aもご用意しました。コストを重視した構成をご希望の場合には、ぜひご覧ください。

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事例No.PC-6601を現行スペックに直した見積もりが欲しい。
シングルセルRNA-Seq解析用マシンとしての利用を想定しており、メモリは128GB以上でCPUコア数も12コア以上を希望する。
予算は、100万円以下の場合と100万円～150万円の場合で提案して欲しい。

PC-6601は旧世代の構成ですので、ご要望に合わせて現行スペックにアップデートした内容でご提案しました。
本構成はご予算100万円以下を想定したご提案ですが、ご予算100万円～150万円想定でCPUのモデルが異なる事例No.PC-9379Bもご用意しています。よりCPU性能の高い構成がご希望の場合には、ぜひご覧ください。

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バイオインフォマティクス、特に次世代シーケンサー解析用としてPCを検討している。
将来的な拡張性のある構成が希望で、ストレージは4TB SSDを搭載したい。
具体的な用途としては、Cell RangerやSTAR、bowtie2などを使った次世代シーケンサー解析と、Rなどを利用した下流解析・図表作成がメイン。
また、機械学習用にGPUを搭載したい。予算は120万円程度。

ご予算とCPU性能との兼ね合いから、Ryzen Threadripperを用いた構成をご提案しました。
メモリは本構成の最大容量の256GBで、ECCモジュールを採用しています。コストを重視する場合は、ECC機能のない通常のDIMMへの変更も可能です。

また、機械学習の予定があることから、GPUとしてRTX3080を搭載しています。
Cell Ranger、STAR、bowtie2 などをお使いいただく上では、特別な描画能力が必要となることはありませんので、コストを重視する場合にはもっと安価なビデオカードへの変更も可能です。ご希望の場合には、お気軽にご相談ください。

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次世代シーケンサーのデータ解析用マシンの導入を考えている。
事例No.PC-6601よりも処理性能が高いCPU、メモリやストレージの容量も事例以上に搭載したい。

コア数を優先する場合、現状ではAMD系CPUの方がコア数を多く設定できるため、64コア構成の見積もりをご提案しました。
メモリ容量は256GBが最大となりますので、より多くのメモリを搭載する必要がある場合にはお気軽にご相談ください。

※本事例の後継スペックは、PC-9569をご覧ください。

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次世代シーケンサーのデータ解析用マシンの導入を考えている。
事例No.PC-6601よりも処理性能が高いCPU、メモリやストレージの容量も事例以上に搭載したい。

事例No.PC-6601をベースに、メモリとCPUコア数を予算内で最大にした構成です。
メモリはCPUごとに6枚の構成が最速ですので、32GB x12枚の384GBとしています。
また、CPUのスペックを優先したため、コスト配分との兼ね合いからストレージの追加はHDD x1台で16TBとしています。
NGS系では、データの書き出し先としてストレージ速度を稼ぐためにRAID構成を推奨する場合がありますが、本事例ではCPUを優先してコスト配分したものとお考えください。

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バイオインフォマティクス解析に使用予定。コア数、スレッドが多いもの(想定20コア程度)、Ubuntu 18.04 Long Term Support(LTS)で使用予定。

バイオインフォマティクス解析とのことで、容量の大きいデータ領域を用意いたしました。OSインストールはお客様にて行われるとのことで無しとしておりますが、弊社でのインストールも可能です。

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次世代シークエンス用の解析ソフト、CLC Genomics Workbenchを動かすPCの購入を検討している。ソフトウェアプレインストールのマシンも販売されているが、単体で100万の予算で用途に適した仕様を検討したい。

ご指定のXeonをベースに、予算の範囲でできるだけ高性能な仕様としております。
搭載メモリは1CPUあたり6枚が速度としてはベストですが、予算の都合と今回の構成では速度面への影響は少ないであろうことから、1CPUあたり3枚構成としております。

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