- 事例No.PC-2424
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分子動力学ソフトGromacs、LAMMPSのプリインストール
参考価格:2000000円お客さまからのご相談内容
分子動力学ソフトGromacsおよびLAMMPSがプリインストールされた計算機を探している。テガラで対応できないか。
テガラからのご提案
MPI+CUDA版を検討中」とのご相談を頂きました。OSはUbuntuまたはCentOSをご希望で、GPUにTesla K20かK20Xを搭載したいとのこと。
ちょうどTesla K40の登場直前であったことから、K40の発表を待ってK40搭載仕様をご提案しました。その他、CPUはXeon E5-2650v2(2.6GHz 8コア)×2、メモリは64GB(REG ECC)、ストレージにはOS&ソフトウェア用にSSD 128GB×2(RAID0)、データ保存用に4TBのHDD×2…といった構成としました。
OSはCentOS 6.4 64bitとし、ご希望に沿ってGromacsとLAMMPSをプリインストールする形にしました。また、今後GPUを増設すると200V-240V電源が必要となることから、200V-240V対応のUPSも合わせてお見積もりしました。




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検索キーワード 分子動力学/シミュレーション/Gromacs/LAMMPS/分子モデリング/力場/GPU/GPGPU/テスラV100/分子間相互作用/蛋白質/共有結合/疎水性相互作用/システム階層/水和エネルギー/アンサンブル平均/分子軌道/計算化学/量子化学/分子設計/コンピュータ支援創薬/生物物理/生体高分子/水素結合/分子構造最適化
事例追加日:2013/12/20
- 事例No.PC-2317
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気象モデルHWRF用ワークステーション
用途:ワークステーション参考価格:709000円大学の研究室の方より、「HWRFという気象モデルの導入をしたく、研究室にワークステーションを設置したい。」とのお問い合わせをいただきました。ご予算は100万円以内で、出来る限り急ぎで入手したいとのこと。
CPUやメモリ容量については、お客様がHWRFに最適な仕様を開発機関に問い合わせた結果、最適なコア数とそれに対するメモリ容量の組み合わせの回答が得られたとのことで、それを教えていただき設計の参考としました。
まず32コア仕様を検討しましたが、Intel製CPUを採用した場合4CPU構成となってしまい高価なため、ご予算との兼ね合いから、今回は2CPUで16コア(8コア×2)の構成でご案内しました。メモリは64GBとしました。OSはHWRFとの相性を考慮し、Fedora 17 64bitを採用しています。
また、もう少しコア数を増やした仕様として、同じく2CPUで10コア×2=20コアの構成も別途ご案内しました。



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事例追加日:2013/11/21
- 事例No.CD-2327
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Gromacsによる 合計20コアCPUの数値計算用PC
用途:数値計算参考価格:680000円分子動力学シミュレーションソフトGromacsで数値計算を行うためのPCとして提案・導入した事例です。
お客さまと打ち合わせを重ねた結果、 CPUはXeon E5-2670v2(2.5GHz 10コア)を2個搭載しました。 合計20コアですが、動作クロックは抑えた仕様です。
GPGPUの搭載も検討しましたが、ご予算と用途を考えるとCPUの性能アップを優先したほうがベターと判断し搭載を見送りました。
また、メモリは本来8枚とするのがベストでしたが、 ご予算の都合で今回は8GB×4枚の32GBとしています。




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検索キーワード
Gromacs,分子動力学シミュレーション,高性能計算,HPC,Xeon,E5-2600v4,20コアCPU,大規模並列処理,Bioinformatics,Molecular Dynamics,Linux,CentOS,Scientific Computing,数値計算,生命科学シミュレーション,分子シミュレーション,計算科学,コンピューターシミュレーション,高速計算,GPU,Tesla,並列プログラミング
主な仕様
CPU Intel Xeon E5-2670v2 (2.50GHz 10コア) x2(合計20コア) メモリ 合計 32GB DDR3 1600 REG ECC 8GB x4 ストレージ HDD 1TB S-ATA ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 ビデオ NVIDIA Quadro K600 1GB DVI-I x1 DisplayPort x1 筐体 タワー型 (幅452x高さ178x奥行x648 mm) OS Ubuntu 12.04 I/F USB2.0 x4 / COM x1/
PCI-E (x16スロット) x3 / PCI-E (x8スロット) x3 / S-ATA x6その他 DVDスーパーマルチドライブ 事例追加日:2013/11
- 事例No.CD-1745
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カメラと連携した画像処理のためのMATLABマシン
用途:画像処理・シミュレーション参考価格:2360000円カメラシステムからの画像取得を行い、MATLABでの画像処理やシミュレーションを目的としたマシンです。MATLABに加えSimulink,MATLAB Compiler,Parallel Computing Toolboxの利用を想定し構成しています。
Tesla K10 x2の2GPUを搭載し、Parallel Computing Toolboxを使いGPU処理も有効に生かせる仕様です。OSはWindows 7とのご指定がありましたので、メモリはOSが認識する最大容量の192GBを搭載。カメラ接続用のフレームグラバーボードも追加しています。





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主な仕様
CPU Intel Xeon 2690 (2.90GHz 8コア) x2 (合計16コア) メモリ 合計192GB DDR3-1600 16GB ECC Registered ×12 ストレージ 512GB SSD S-ATA / 3TB S-ATA x4 (RAID5時 9TB) ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 ビデオ NVIDIA Quadro 2000 筐体 タワー型 幅178x高さ462x奥行673(mm) OS Microsoft Windows 7 Pro 64bit 日本語版 I/F USB2.0 x4 / シリアルポート x1
PCI-E (x16スロット) x4 / PCI-E (x8スロット) x2 /
PCI-E (x1スロット) x1 / S-ATA2 x8 / S-ATA3 x2GPU NVIDIA Tesla K10 x2 その他 DVDスーパーマルチドライブ / 内蔵RAID機能(HOST RAID) /
Frame Grabber Board (Imperx Framelink PCIe x1 Card)事例追加日:2013/08
- 事例No.CD-2155
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シングルスレッドのモンテカルロシミュレーション用マシン
用途:モンテカルロシミュレーション参考価格:209000円ご予算30万円で、シングルスレッドのCプログラムによるモンテカルロシミュレーションが高速に動くマシンをご提案しました。
シングルスレッド処理では1コアあたりのクロック数が重要となります。ただし一般的にはモンテカルロシミュレーションは並列化と相性がいいため、後々CPUのコア数やメモリ数を増やせる拡張性重視の仕様と、シングルスレッド処理能力を重視した仕様の2種類をご提案し、今回は拡張性重視の仕様でのご注文をいただきました。 なお、OSはCentOSをプリインストールしています。




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主な仕様
CPU Intel Xeon E5-1620 (3.60GHz 4コア) メモリ 合計 32GB DDR3 1600 REG ECC 8GB x4 ストレージ HDD 500GB S-ATA ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 ビデオ Radeon HD6450 1GB DDR3 PCI-E 筐体+電源 ミドルタワー型 (幅200x高さ465x奥行481mm) +600W電源 OS CentOS 6.4 64bit版 I/F USB2.0 x8 / USB3.0 x2
PCI-E (x16スロット) x2 / PCI-E (x4スロット) x2 / PCI x1 / S-ATA x6その他 DVDスーパーマルチドライブ 事例追加日:2013.08
- 事例No.PC-1837
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大気環境シミュレーション用PC
用途:大気環境シミュレーション参考価格:900000円「大気質モデルCMAQを用いた大気環境シミュレーションに使用するためのPCがほしい」とのご相談をいただきました。
OSは、CentOS 6.3 64bitをプリインストールし、CPUは、6コアのXeon E5-2640×2、メモリ32GB、データ用に256GBのSSD×1と1TB HDD×4(RAID10)を搭載しました。同時にご依頼いただいたソフトウェア、プリンタ等とあわせてご提案しました。




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事例追加日:2012/12/19
- 事例No.PC-SPE037
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Quadro 4000搭載の3Dシミュレーション用マシン
用途:3Dシミュレーション参考価格:378000円お客さまより「GridgenおよびFFTアナライザというソフトウェアが快適に動作する仕様のPCが欲しい」というご要望を頂き提案した事例です。
GridgenがWindows 7の64bit版に対応していなかったため(2012年10月現在)、OSやメモリ等を32bit構成としました。またグラフィックボードにはQuadro 4000という強力な製品を搭載しました。さらに23インチのIPSパネル搭載液晶ディスプレイを追加しています。




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主な仕様
CPU Intel Core i7 3960X 3.30GHz L3/15MB 6C/12T メモリ 合計 4GB DDR3-1600 2GB PC3-12800 ×2 ストレージ HDD 1TB S-ATA ビデオ NVIDIA Quadro 4000 2GB DVI-I x1DisplayPort x2 ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 筐体+電源 ミドルタワー型筐体 (202x440x485 mm) +600W I/F USB3.0 x2 / USB2.0 x8 / IEEE1394a x1
PCI-E Gen3(x16スロット) x2 / PCI-E Gen3(x8スロット) x1
PCI-E Gen2(x1スロット) x2 / PCI x1 / S-ATA 3G x4 / S-ATA x6OS Microsoft Windows 7 Professional 32bit 日本語版 その他 ディスプレイ: 23型ワイド FullHD IPS DVI対応 /
DVDスーパーマルチドライブ事例追加日:2012/10/28
- 事例No.PC-SPE038
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Tesla搭載の 大気環境シミュレーション用マシン
用途:大気環境シミュレーション参考価格:890000円お客さまより「CMAQを用いた大気環境シミュレーション用のPCが欲しい」とのご要望を頂き、細かいスペックのご希望を受けて提案した事例です。
CPUは6コアのXeon E5を2個搭載し合計12コアとしました。また、GPGPU演算用にNVIDIA Tesla C2075も搭載しました。メインストレージにはSSDを搭載し、データ領域には1TBのHDDを4個搭載してRAID10を構築することで速度と容量を確保しました。




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主な仕様
CPU Intel Xeon E5-2630 (2.3GHz 6C/12T) × 2 (合計12コア) メモリ 合計16GB DDR3 1333 REG ECC 4GB × 4 ストレージ 256GB SSD S-ATA / HDD 1TB S-ATA x4(RAID10) ビデオ GeForce GT640 2GB PCI-E / Nvidia Tesla C2075 ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 筐体 タワー型筐体 (178x452x648 mm) I/F USB2.0 x4 / シリアルポート x1
PCI-E (x16スロット) x3 / PCI-E (x8スロット) x3 / S-ATA x6OS CentOS 6.3 64bit その他 Blu-rayディスクドライブ / RAID Adaptec ASR-6405E /
27型ワイド液晶 iiyma PLE2773HDS-B1 /
Microsoft Office2010 Professional 製品版事例追加日:2012/11/28
- 事例No.PC-SPE024
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CAE 有限要素法解析ソフトウェア向けの リーズナブルなPC
用途:有限要素法解析参考価格:212000円CAEソフトウェアを利用して3次元シミュレーションを行うため、20万円程度でPCを提案して欲しいとのご要望で提案した事例です。
性能よりもご予算に収めることを優先して設計していますが、2CPUで合計8コア、8GBのメモリ、Quadro 600搭載などなどそれなりの性能を持たせました。




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主な仕様
CPU Xeon E5607 (2.26GHz/8MB 4.8GT/s 4コア) × 2 (合計8コア) メモリ 合計 8GB DDR3-1333 PC3-10600 ECC Registered 2GB ×4 ストレージ HDD 500GB S-ATA ビデオ NVIDIA Quadro 600 ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 筐体+電源 ミドルタワー筐体 (202x440x485 mm) +600W I/F USB2.0 x6 / シリアルポート x1 / PS/2 x2
PCI-E (x16スロット) x1 / PCI-E(x4スロット) x2 / PCI x2 / S-ATA x6OS なし 事例追加日:2013/2/15
- 事例No.PC-SPE022
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Tesla C2075×4搭載の高性能GPGPU WS
用途:高速シミュレーション参考価格:2060000円200万円ほどのご予算でMATLABおよびParalell Computing Toolboxを利用し、マルチコアCPUとGPGPUによる高速シミュレーションを行えるマシンが欲しいとのご要望から設計した事例です。CPUは6コアで3GHzオーバーのXeonを2個、メモリ96GB、GPUにはNVIDIA Tesla C2075を4枚搭載しました。ご予算に応じて各部の性能のバランスが取れた仕様としました。




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主な仕様
CPU Xeon X5675 (3.06GHz 6C/12T) × 2 (合計12コア) メモリ 合計 96GB DDR3 1333 REG ECC 8GB × 12 ストレージ Intel SSD320 120GB システム用 ビデオ NVIDIA Tesla C2075 x4 (CUDA) ネットワーク 10/100/1000Base-T x2 筐体+電源 タワー型筐体 (178x452x673 mm) +1400W I/F USB2.0 x4 / シリアルポート x1 / PS/2 x2
PCI-E G2(x16スロット)x4 / PCI-E G2(x4スロット)x2
PCI-E G2(x1スロット)x1 / S-ATA x6OS なし その他 DVDスーパーマルチドライブ 事例追加日:2012/3/30
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弊社製PCの保証内容は、お見積もりメールでもご案内しています。
■お問合せ先
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テガラ株式会社 サポートサイト
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ただし、お客様による破損や、ソフトウェアに起因するトラブルなど保証規定にて定める項目に該当する場合は保証対象外となります。
保証期間経過後も、PCをお預かりしての初期診断は無料で実施しております。
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PCのご購入時にトータル5年までの延長保証をご選択いただけます。また、ご購入後にも延長保証を申し込むことができます。
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| オンサイト保守サポート | |
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「お客様だけのオーダーメイドPC」を製作しています。
用途に応じた細かなアドバイスや迅速な対応がテガラの強みです。
上記の仕様はテガラでお客様に提案したPC構成の一例です。
掲載内容は提案当時のものであり、また使用する部材の供給状況によっては、現在では提供がむずかしいものや、部材を変更してのご提案となる場合がございます。
参考価格については、提案当時の価格(送料込・税込)になります。
ご相談時期によっては価格が異なる場合がございますので、あらかじめご了承ください。












