事例No.PC-TW2D265295

LAMMPS用ワークステーション:予算200万円構成 (2026年2月版)

用途:LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算/量子科学計算 (GAMESSなど)
参考価格:2183500

お客さまからのご相談内容

LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算を実施する予定がある。そのためのワークステーションを検討したい。予算200万円程度での見積もりを希望する。

OSはWindows 11、メモリ128GB、将来的にGAMESSなどCPU負荷の高いアプリも利用する想定があるため、バランスの良い計算機構成を提案して欲しい。

テガラからのご提案

本構成では、事例No.PC-TW2D265278から一段階性能を引き上げ、GPU計算と機械学習の双方で高いパフォーマンスを発揮できる、バランスの良いワークステーションを目指しました。

LAMMPS、機械学習処理、さらには将来的な計算規模の拡大を見据え、GPUリソースの強化とCPU性能の維持を両立した設計です。

GPU構成:RTX PRO 5000 (48GB) を採用

本構成の中心となるのは NVIDIA RTX PRO 5000 (48GB) です。
事例No.PC-TW2D265278の PRO 4000 (24GB) に比べてVRAMが倍増したことで、

  • 大規模分子系を扱うシミュレーション
  • 機械学習モデルでのバッチサイズ拡大

といった用途で、研究の自由度が大きく向上します。

さらに、DisplayPort ×4 の出力構成により、多画面環境にも柔軟に対応します。

CPU構成:Xeon W5-2565X (18コア) を継続採用

GPUを強化しつつ、CPUは従来と同じ Xeon W5‑2565X (18コア/36スレッド) を採用しています。

GPU主体のワークロードであっても、

  • LAMMPS の CPU 併用計算
  • 前処理・後処理の安定した実行

が重要となるため、コア数・クロック・メモリ帯域のバランスが取れた本CPUを継続することで、全体の処理効率を維持しています。

メモリ・ストレージ構成

    • 128GB DDR5 ECC (32GB ×4)
      大規模データ処理や長時間計算を安定して実行できる構成
    • 2TB NVMe SSD (Gen4)
      解析ファイルの高速読み書きに対応し、日常的な入出力を快適に

拡張性と安定性

PCIe x16 スロットを4基搭載し、将来的なGPUの増設にも柔軟に対応できます。
電源は 1500W Platinum を選定し、高負荷計算を長時間行う研究環境でも安定運用が可能です。


テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。


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この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU Intel Xeon W5-2565X 3.20GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 18C/36T
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 4
ストレージ 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA RTX PRO5000 48GB (DisplayPort x4)
ネットワーク on board (2.5GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 ミドルタワー 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit

キーワード

・LAMMPSとは

LAMMPS は大規模な原子・分子系を扱えるオープンソースの分子動力学シミュレーションソフトです。
材料科学、ナノテクノロジー、ソフトマター分野の大学・企業研究者に利用され、並列計算やGPU対応により超大規模系の解析が可能です。力場やモデルの自由度が高く、独自手法の実装や先端的な材料研究に適している点が大きな強みです。

参考:LAMMPS Molecular Dynamics Simulator ※外部サイトに飛びます

・GAMESS (US) とは

GAMESS (US) は、アイオワ州立大学のMark Gordon教授らが開発した第一原理量子化学パッケージ。Hartree-Fock法や密度汎関数法 (DFT) などの計算手法をサポートし、電子相関補正や励起状態計算など高度な機能を備えている。また、フラグメント分子軌道法 (FMO) や溶媒効果を含む計算も可能で、幅広い分子物性解析に対応。

参考: Gordon Group/GAMESS Homepage ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2026/03/02
事例No.PC-TW2D265278

LAMMPS用ワークステーション:予算150万円構成 (2026年2月版)

用途:LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算/量子科学計算 (GAMESSなど)
参考価格:1512500

お客さまからのご相談内容

LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算を実施する予定がある。そのためのワークステーションを検討したい。予算150万円程度での見積もりを希望する。

OSはWindows 11、メモリ128GB、将来的にGAMESSなどCPU負荷の高いアプリも利用する想定があるため、バランスの良い計算機構成を提案して欲しい。

テガラからのご提案

本構成では、GPUを活かした LAMMPS 計算と、CPU負荷が大きい化学計算のどちらにも対応できる「万能型ワークステーション」を目指しました。まずは 1GPU 構成で研究を開始し、必要に応じてGPUを追加できる拡張性も備えています。

GPU構成

LAMMPS の GPU高速化と機械学習処理を両立するため、24GBメモリを搭載したNVIDIA RTX PRO 4000を採用しました。単精度演算性能とGPUメモリ容量のバランスが良く、安定した計算環境を構築できます。

筐体自体が複数GPU構成に対応しているため、将来的な GPU 増設も柔軟に行えます。

CPU構成

CPUにはXeon W5-2565X (18コア) を搭載し、LAMMPSのCPU並列処理やGAMESSなどの量子化学計算に十分対応できるコア数を確保しました。GPU負荷型・CPU負荷型いずれの計算にも対応できるため、研究用途の幅を広げる構成となっています。

メモリ・ストレージ構成

  • メモリ:128GB (DDR5 ECC)
    大規模系の分子動力学計算にも対応できる容量を確保しています。
  • ストレージ:2TB NVMe SSD
    解析データの高速な読み書きを実現し、日常的な計算・可視化作業の効率を向上させます。

テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。


類似条件のワークステーション事例

Gaussian・LAMMPS・GROMACS 併用向けワークステーション事例No.PC-TRNX254496
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主な仕様

CPU Intel Xeon W5-2565X 3.20GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 18C/36T
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 4
ストレージ1 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA RTX PRO4000 24GB(DisplayPort x4)
ネットワーク on board (2.5GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 ミドルタワー 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit

キーワード

・LAMMPSとは

LAMMPS は大規模な原子・分子系を扱えるオープンソースの分子動力学シミュレーションソフトです。
材料科学、ナノテクノロジー、ソフトマター分野の大学・企業研究者に利用され、並列計算やGPU対応により超大規模系の解析が可能です。力場やモデルの自由度が高く、独自手法の実装や先端的な材料研究に適している点が大きな強みです。

参考:LAMMPS Molecular Dynamics Simulator ※外部サイトに飛びます

・GAMESS (US) とは

GAMESS (US) は、アイオワ州立大学のMark Gordon教授らが開発した第一原理量子化学パッケージ。Hartree-Fock法や密度汎関数法 (DFT) などの計算手法をサポートし、電子相関補正や励起状態計算など高度な機能を備えている。また、フラグメント分子軌道法 (FMO) や溶媒効果を含む計算も可能で、幅広い分子物性解析に対応。

参考: Gordon Group/GAMESS Homepage ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2026/03/02
事例No.PC-TW2D265296

LAMMPS用ワークステーション:予算280万円構成 (2026年2月版)

用途:LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算/量子科学計算 (GAMESSなど)
参考価格:2750000

お客さまからのご相談内容

LAMMPSでの分子動力学計算と機械学習ポテンシャルを用いた計算を実施する予定がある。そのためのワークステーションを検討したい。
量子化学計算 (GAMESS など) の実施も予定しているため、予算280万円程度で最大性能の構成を希望。
GPUの最上位モデルを搭載した構成を検討したい。

テガラからのご提案

GPU性能を最優先に、量子化学計算や LAMMPS の GPU版を最大限活かせるハイエンド構成です。
将来的な GPU 増設も視野に入れた設計で、長期的に研究環境を支えるワークステーションになっています。

最上位クラス GPU「RTX PRO 6000 Max-Q」を搭載

96GB の大容量 VRAM を備えた RTX PRO 6000 Max-Q を採用しています。
分子動力学や量子化学など、大規模データを扱うシミュレーションはもちろん、深層学習にも余裕をもって対応可能です。
1GPU構成ながら非常に高い処理性能とVRAM容量を持ち、GPU依存の大規模計算で特に真価を発揮します。

CPUは12コアモデルで最適バランス

GPUが主役となるワークロードで費用対効果を最大化するため、CPUは Xeon W5-2545 (12コア) を選定しました。
GPUの性能を活かしつつ、全体の予算バランスを最適化した構成です。

高負荷計算でも安定して動作

128GBメモリ、2TB NVMe SSD、1500W高効率電源、拡張性の高い大型ケースを採用し、CPU・GPUどちらの高負荷計算でも安定して稼働するよう設計しています。

長期運用を前提に、信頼性と拡張性を両立させたワークステーション構成です。


テガラのオーダーメイドPC製作サービスは、導入時の用途に加え、将来的な研究規模の拡大を見据えたシステムの拡張にも対応しています。
各種ソフトウェア要件に応じた構成のご提案はもちろん、研究環境全体の構築に関するご相談も承っています。
お客様のニーズに合わせて最適なソリューションをご提供しますので、どうぞお気軽にお問い合わせください。


類似条件のワークステーション事例

Gaussian・LAMMPS・GROMACS 併用向けワークステーション事例No.PC-TRNX254496
Gaussian・LAMMPS・GROMACS 併用向けワークステーション
GROMACS・LAMMPS用ワークステーション事例No.PC-TWTJ253956
GROMACS・LAMMPS用ワークステーション
 
Autodock Vina・GROMACS用ワークステーション事例No.PC-TRNJ253648
LAMMPS用ワークステーション:予算200万円構成
 
研究室向け ワークステーション導入相談会 オンライン開催 安心と信頼をお届けする、品質へのこだわり
2025年若手研究応援キャンペーン ご紹介キャンペーン
材料工学・マテリアル研究向けマシン選定のポイント 第一原理計算用マシンってどう選べばいいの?
材料計算・解析を1台のマシンで完結する、カスタムPC製作 GPUで材料探索が速くなる。最適構成のカスタムPC製作
第一原理計算向け WIEN2k ターンキーシステム パッケージモデル お客様の声
NAS構築・設定サービス テグシスのALL Flash Storage

この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU Intel Xeon W5-2545 3.50GHz (TB3.0時 最大4.7GHz) 12C/24T
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 4
ストレージ 2TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA RTX PRO6000 Max-Q 96GB (DisplayPort x4)
ネットワーク on board (2.5GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 ミドルタワー 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit

キーワード

・LAMMPSとは

LAMMPS は大規模な原子・分子系を扱えるオープンソースの分子動力学シミュレーションソフトです。
材料科学、ナノテクノロジー、ソフトマター分野の大学・企業研究者に利用され、並列計算やGPU対応により超大規模系の解析が可能です。力場やモデルの自由度が高く、独自手法の実装や先端的な材料研究に適している点が大きな強みです。

参考:LAMMPS Molecular Dynamics Simulator ※外部サイトに飛びます

・GAMESS (US) とは

GAMESS (US) は、アイオワ州立大学のMark Gordon教授らが開発した第一原理量子化学パッケージ。Hartree-Fock法や密度汎関数法 (DFT) などの計算手法をサポートし、電子相関補正や励起状態計算など高度な機能を備えている。また、フラグメント分子軌道法 (FMO) や溶媒効果を含む計算も可能で、幅広い分子物性解析に対応。

参考: Gordon Group/GAMESS Homepage ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2026/03/02
事例No.PC-TS2M253330

Gaussian・Quantum ESPRESSO 計算用ワークステーション

用途:Gaussian、Quantum ESPRESSO、CP2K
参考価格:1006500

お客さまからのご相談内容

 

Windows OS環境で、複数ユーザーが同時に計算処理を実行できる科学技術計算サーバーの導入を検討中。

主にGaussianを使用するため、CPUの性能を重視した構成を希望。
Quantum EspressoやCP2Kなどの導入も視野に入れている。
現在はGPU計算を使用していないが、GeForce RTX 2080 Tiを保有しており、増設可能な拡張性も確保したい。

また、Windows Serverの運用は初めてのため、設定やライセンスについても相談しながら慎重に進めたい。

テガラからのご提案

Gaussianを中心とした量子化学計算に適した構成として、初期はワークステーションとして運用しつつ、将来的なWindows Serverへの移行にも柔軟に対応可能なサーバー設計をご提案しました。

Gaussian対応・将来のサーバー運用を見据えた構成

本構成は、GaussianなどのCPU依存型ソフトに最適化されており、単体のワークステーション利用時にも十分な性能を発揮します。
主な構成要素は以下の通りです:

  • CPU:Intel Xeon Silver 4510 x 2基
    → 高いマルチコア性能により、並列ジョブ処理に対応。Gaussianなどの計算処理に最適。
  • メモリ:128GB(最大4TBまで拡張可能)
    → 空きスロットを活用することで、将来的なメモリ増設にも柔軟に対応。複数ジョブの同時実装時にも安定した動作を実現。

Windows Serverを選ぶ前に知っておくべきこと

今回はご予算とOSの制約の兼ね合いからWindows 11を採用いたしましたが、将来的にWindows Server運用に移行も可能です。

採用の際の注意点

ライセンス体系やCAL (Client Access License) の必要性など、費用面も含めてご説明いたします。

Windows Serverのライセンス費用は、CPUのコア数に応じて決まるため、多コアCPUの場合、ライセンス費用が大きくなる場合があります。
加えて、複数ユーザーで同時接続する場合、CAL(Client Access License)の追加購入が必要となり、総費用に影響を与える点にも注意が必要です。
さらに、GeForceシリーズはWindows Server環境での公式サポート対象外となるため、GPUの運用について、あらかじめ方針を確認しておくと安心です。

このように、Windows Serverへの移行には、コスト面・運用面の両面で計画的な準備が必要となります。
将来的な拡張を見据えたシステム設計の一環として、これらの点をあらかじめ把握しておくことをおすすめします。

導入までの流れを、実際のやりとりからご紹介

別件ではございますが、実際にGaussianの導入を検討された研究者の方とのやりとりをもとに、構成決定までの流れを詳しくご紹介しています。

初めてのサーバー導入でも、対話を重ねながら最適な構成を導き出すプロセスをご覧いただけます。

参考:【導入事例】研究開発者のお悩みに”対話”で応えるテグシスの提案力

 

このような分野で活躍されている方へ

  • 計算化学
  • 理論化学
  • 材料科学
  • 分子シミュレーション
  • 物性物理学

用途や運用環境に応じたカスタマイズにも柔軟に対応可能です。構成相談から導入まで、お気軽にお問い合わせください。


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この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU Intel Xeon Silver 4510 2.40 GHz (TB 4.10GHz) 12C/24T x 2基構成
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 16GB x 8
ストレージ1 1TB SSD S-ATA
ビデオ GeForce RTX 2080Ti (支給品)
ネットワーク on board (10GBase-T x2)
筐体+電源 タワー型筐体 1000W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit

キーワード

・Gaussianとは

Gaussianは分子・材料の電子構造や反応経路などを高精度に解析できる量子化学計算ソフトです。
大学や企業の研究現場で幅広く活用されており、特に有機化学や材料科学の分野で活躍しています。HF法やDFT法など多様な計算手法に対応し、複雑な分子系の解析にも強みを発揮します。

参考:Gaussian, Inc. ※外部サイトに飛びます

・Quantum Espressoとは

Quantum ESPRESSOは、物質科学や化学分野の研究者が、原子・分子・個体などの電子構造を解析するために使用する、オープンソースの第一原理計算パッケージです。
密度汎関数法(DFT)を中心に、擬ポテンシャル法と平面波基底を用いた高精度な電子状態計算が可能で、新素材の設計や物性予測、材料モデリングなどに広く活用されています。 また、MPIによる大規模な並列計算にも対応しており、スーパーコンピュータ環境での利用も多く、大学・研究機関・企業の先端研究で導入が進んでいます。

参考:Quantum ESPRESSO ※外部サイトに飛びます

・CP2Kとは

CP2Kは、材料科学・化学・生命科学などの研究者が、原子レベルでの構造や性質を解析するために使用するオープンソースのシミュレーションソフトウェアです。
固体、液体、分子、結晶、生体分子など、幅広い物質系を対象に、量子力学と古典力学を組み合わせた計算手法(QM/MMなど)を用いて、高精度な構造解析や反応シミュレーションが可能です。 Fortran 2008で記述されており、量子化学・固体物理・分子動力学など多様な手法に対応。新素材の設計、触媒反応の解析、生体分子の挙動予測など、先端研究の現場で広く活用されています。

参考:CP2K ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/8/7
事例No.PC-TRNM253239

機械学習・DFT計算 両立ワークステーション

用途:Alphafold3による構造予測、ESM Cambrianの解析、機械学習、MDシミュレーション、Gaussian
参考価格:1366200

お客さまからのご相談内容

事例No.PC-24001322を見ての問い合わせ。
Alphafold3やESM Cambrianによる解析、および機械学習に使用するPCを購入したい。
将来的にはGromacsやGaussianの利用も想定しており、特にGaussianへの対応を考慮して、高性能のCPU、GeForce RTX 4090、128GB以上のメモリを希望。

 

参考:事例No.PC-24001322 機械学習用マシン

テガラからのご提案

深層学習や量子化学計算など、GPU負荷型・CPU負荷型のいずれの処理にも対応できるよう、計算性能とメモリ構成を最適化しました。
Alphafold3、scikit-learn、Gaussianなどの研究向けツールを安定かつ効率的に活用できます。

Alphafold3を主目的としたGPU

Alphafold3は、深層学習を用いたタンパク質構造予測ソフトウェアで、推論処理の大部分をGPU上で実行します。
当初はGeForce RTX 4090をご希望いただきましたが、すでに終息していたため、同世代のAdaシリーズであるRTX 4500 Adaをご提案しました。

その後、お客様から「GeForce RTX 5090でAlphafold3が動作している事例を確認した」とのご連絡があり、最新のRTX 5090GPUを採用することとなりました。
なお、この情報はGitHub上のユーザー報告によるもので、公式サポートではありませんが、社内検証と複数の事例を踏まえ、実環境での安定稼働を確認しています。

参考:Alphafold3 GitHubページ

Gaussianを快適に運用するためのCPU性能とメモリ容量

DFT計算では、以下の3要素が性能を左右します。

  • コア数:並列処理性能に直結。
  • クロック周波数:シングルコア性能を左右
  • メモリ容量・帯域:大規模計算の安定性を確保

本構成には、16コア32スレッド・最大5.7GHz動作の Ryzen 9 9950X を採用。並列処理とシングルスレッド性能のバランスに優れ、最大192GBのメモリを搭載しています。
大規模分子系の計算ではメモリ不足が性能低下の要因となるため、本構成ではCPUが対応する最大容量までメモリを搭載しています。
GPUとのバランスも良く、高負荷演算に対応できる構成です。

導入までの流れを、実際のやりとりからご紹介

こうした構成をご提案するまでの流れを紹介した事例もございます。
Gaussian導入にあたってのご相談内容、構成決定までの流れをご紹介しています。
検討の参考に、ぜひご覧ください。

参考:【導入事例】研究開発者のお悩みに”対話”で応えるテグシスの提案力

このような分野で活躍されている方へ

  • 構造生物学
  • 計算化学
  • 創薬研究
  • 機械学習
  • バイオインフォマティクス

主に使用したいソフトウェアや今後の方針に応じて、柔軟なカスタマイズが可能です。初期相談からカスタマイズまで、お気軽にお問い合わせください。


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この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU AMD Ryzen9 9950X 4.30GHz(Boost時最大5.70GHz) 16C/32T
メモリ 合計192GB DDR5-5600 48GB x 4
ストレージ1 1TB SSD S-ATA
ストレージ2 4TB SSD M.2 NVMe Gen4
ビデオ NVIDIA GeForce RTX5090 32GB
ネットワーク on board(2.5G x1) Wi-Fi,Bluetooth
筐体+電源 ミドルタワー型筐体 1500W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 24.04
その他 27型ワイド WQHD 液晶ディスプレイ

キーワード

・Alphafold3とは

AlphaFold3はDeepMindが開発したタンパク質の立体構造予測アルゴリズムです。
従来版よりも精度と柔軟性が向上しており、複雑な複合体や分子相互作用の推定にも対応。創薬や構造生物学の研究に活用されています。

参考:DeepMind ※外部サイトに飛びます

・Gromacsとは

GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) は、オランダのフローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのパッケージです。
主に、タンパク質や脂質、拡散などの生化学分子用に設計されています。

参考:Gromacs ※外部サイトに飛びます

・Gaussianとは

GGaussianは量子化学計算に特化したソフトウェアで、分子の電子構造・化学反応・分光特性の理論計算を高精度に行えます。
量子化学計算や分子動力学計算に限らず、様々な用途で利用され、大学や企業の研究で分子設計・構造解析に広く利用されています。

参考:Gaussian ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/7/29
事例No.PC-TUKD252437

大規模数値計算向けMAGMA専用マシン

用途:MAGMA
参考価格:561000

お客さまからのご相談内容

普段からMAGMAを使用した計算を行っているが、新たにMAGMA専用の計算用PCを購入したい。
現在使用している構成より速ければ速いほど良いので、オススメや購入時期について教えてほしい。

現在使用している構成は下記の通り。

CPU:Core i9-14900K 3.20GHz (8C/16T) + 2.40GHz (16C/16T)
メモリ:合計 128GB DDR5-5600 32GB  x 4
ストレージ:500GB SSD S-AT
ビデオ:NVIDIA GeForce GT710 1GB
OS:Ubuntu 22.04

テガラからのご提案

現在使用されているマシン構成を基に、2025年7月現在の最新CPUを搭載した構成です。

MAGMAで大規模行列計算の性能を引き出すには、最新世代のマルチコアCPUと十分なメモリ帯域幅を備えることが重要です。
本構成は高クロック動作が可能なIntel Core Ultra 9 285Kと128GBメモリを搭載しており、数値線形代数計算の性能向上が期待できます。

こちらの事例の参考価格は、PC本体のみの価格です。
MAGMAライセンスも併せてご購入いただけます。
MAGMAライセンスの詳細はこちら。
MAGMAの概要や活用事例については、以下のページでも詳しく紹介しています。

参考:数式処置ソフトウェアMAGMAでの計算に最適化したマシン

このような分野で活躍されている方へ

  • 数値解析
  • 計算科学
  • 物理シミュレーション
  • 機械学習
  • 材料工学

MAGMAの使用方法や重視する点に合わせた構成をご提案いたします。
掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

2025年若手研究応援キャンペーン ライフサイエンス研究開発者向け 特別キャンペーンのご案内
ライフサイエンス研究を加速するためのPC環境構築ガイド
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バイオインフォマティクス向け マシン選定のポイント お客様の声
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この事例に近い条件で無料で見積もり相談する

通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

主な仕様

CPU Intel Core Ultra 9 285K 3.70GHz (8C/8T) + 3.20GHz (16C/16T)
メモリ 合計128GB DDR5 5600 32GB x 4
ストレージ1 500GB SSD S-ATA
ビデオ GeForce GT 1030 2GB (DVI-Dx1,HDMIx1)
ネットワーク on board (2.5GbE x1/5GbE x1) Wi-Fi x1
筐体+電源 タワー型筐体 1000W 80PLUS PLATINUM
OS Ubuntu 22.04

キーワード

・MAGMAとは

MAGMAは、数値線形代数計算ライブラリ。
行列計算や線形方程式解法、特異値分解などの高速処理を可能にし、科学技術計算や工学分野での大規模シミュレーション計算に広く利用される。高性能なCUDA対応GPUを搭載すればGPUアクセラレーションが可能になる。

参考:MAGMA公式サイト ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/7/8
事例No.PC-25000487

Gaussian向け量子化学計算用マシン

用途:量子化学計算 (Gaussian)
参考価格:1504800

お客さまからのご相談内容

Gaussian等の量子化学計算を実行可能なマシンとして、モデルPCシミュレーションで下記のスペックのマシンを試算した。

CPU :Intel Xeon Gold 5520+ 2.20GHz (TB 4.00GHz) 28C/56T x 2基構成
メモリ:合計256GB DDR5 5600 REG ECC 16GB x 16
GPU:NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x 4)
ストレージ:1TB SSD S-ATA
電源:1000W 80PLUS PLATINUM
OS:Microsoft Windows 11 Pro for WS 64bit

モデルPCでは予算の160万円 (税込) を超えるため、上限内でGaussianが快適に動作する構成を提案してほしい。

テガラからのご提案

ご連絡いただいたご希望要件に合わせて構成を検討しました。

Gaussian 16は、分子構造の最適化やエネルギー解析などを行う量子化学向けのソフトウェアで、研究や開発の現場で広く活用されています。
この種の処理は負荷が高く、効率よく運用するにはシステムのスペックが重要です。
本ソフトウェアは、マルチスレッドによる並列実行を活用することで、処理時間を大幅に短縮できます。

構成について

並列処理機能を最大限活用するため、ご希望の金額内で可能な限りコア数を確保できる「AMD Ryzen Threadripper 7970X 4.00GHz (boost 5.3GHz) 32C/64T」を採用しました。

Gaussian 16で原子数50以上または基底関数500以上の計算を行う場合は、1コアあたり4GB以上のメモリを実装することが推奨されています。
メモリは余裕をもって256GB搭載しており、高負荷な処理にも対応可能です。

本仕様で採用しているマザーボードは、最大で4枚までのメモリを実装できます。
さらに容量を増やす場合は、現在のモジュールをすべて容量の大きいものに交換する必要があります。

ご参考までに

本ケースではお客様のご予算の範囲内でストレージの性能向上や容量の拡張を図ることで、より安定した運用環境を構築することもできます。

弊社は Gaussian 16をはじめ、材料工学やマテリアル研究など、他の高度な計算ソフトに適したシステムをご提案しています。
それぞれの手法に適したPCスペックについては、以下のページで詳しくご紹介しています。

 

ご予算やご使用のソフトウェア、運用方法に合わせて最適なパーツ構成をご提案いたします。掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。


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主な仕様

CPU AMD Ryzen Threadripper 7970X 4.00GHz (boost 5.3GHz) 32C/64T
メモリ 合計256GB DDR5 5600 REG ECC 64GB x 4
ストレージ1 1TB SSD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x 4)
ネットワーク on board (2.5GbE x 1 10GBase-T x 1) Wi-Fi
筐体+電源 タワー型筐体 1000W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Pro for WS 64bit

キーワード

・Gaussianとは

Gaussianは、米国のGaussian社の開発する計算化学用ソフトウェア。
電子構造や分子特性などの予測計算が可能であり、量子化学計算や分子動力学計算に限らず、様々な用途で利用される。

参考: Gaussian ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/6/9
事例No.PC-25000248

GAMESS(US)用ワークステーション

用途:原子数100程度の構造体のエネルギー計算 (構造最適化)
参考価格:997700

お客さまからのご相談内容

GAMESS(US)を用いて、原子数100程度の構造体のエネルギー計算を行いたい。
予算取りのための情報収集として、現状の想定予算でどの程度のスペックが実現できるのかを知りたい。
使用するソフトウェアはGAMESS(US)の最新版(version June 30, 2023 R1 for Microsoft Windows)で、予算80万~100万円くらいを想定している。GAMESSの利用は初めてなので、まずは普通に使用できる計算環境を用意したい。

テガラからのご提案

CPU計算のみを考慮した構成でのご案内

GAMESSの利用が初めてというお話を踏まえて、複雑なGPU計算は一旦考慮せず、CPU計算のみを考慮してPC構成を検討しました。そのため、GPUは画面描画用としてNVIDIA RTX A400としています。将来的にGPU計算が必要になった場合、RTXシリーズのGPUであれば交換可能な電源容量を確保していますので、導入後のカスタマイズにも対応しています。


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主な仕様

CPU Intel Xeon W7-2575X 3.00GHz (TB3.0時 最大4.8GHz) 22C/44T
メモリ 合計128GB DDR5 5600 REG ECC 32GB x 4
ストレージ 1TB SSD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX A400 4GB (MiniDisplayPort x4)
ネットワーク on board (2.5GbE x1 /10GbE x1)
筐体+電源 ミドルタワー筐体 1000W 80PLUS PLATINUM
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit

 

キーワード

・GAMESS(US)とは

GAMESS(US)は、アイオワ州立大学のMark Gordon教授らが開発した第一原理量子化学パッケージ。Hartree-Fock法や密度汎関数法 (DFT) などの計算手法をサポートし、電子相関補正や励起状態計算など高度な機能を備えている。また、フラグメント分子軌道法 (FMO) や溶媒効果を含む計算も可能で、幅広い分子物性解析に対応。

参考: Gordon Group/GAMESS Homepage ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2025/04/22
事例No.PC-11740

AMD EPYC搭載 量子科学計算用マシン

用途:GROMACSを用いた量子化学計算
参考価格:1440000

お客さまからのご相談内容

下記の要件で、量子化学計算用マシンを提案して欲しい。

CPU AMD EPYC 9254
メモリ 384GB
ストレージ 1TB HDD S-ATA x4台
OS Ubuntu22.04
筐体 1Uラックマウント筐体
その他 GROMACSのプリインストール
保証期間3年(標準保証1年 + 延長保証2年)

テガラからのご提案

お客さまご希望の条件に沿った構成をご提案しました。

第 4 世代 AMD EPYCの高ワットパフォーマンス

第 4 世代 AMD EPYCシリーズの24コアモデル AMD EPYC 9254を搭載した構成です。
第 4 世代 AMD EPYCシリーズは高い省電力性能を備えており、本構成に搭載のAMD EPYC 9254のTDPも200Wです。
200WのTDPは同価格帯のIntel製Xeon Scalableシリーズの24コアモデルIntel Xeon Gold 6442Y (TDP:225W) と比較しても低い数値であり、高いワットパフォーマンスによる消費電力量の低減が期待できます。

GROMACSの事前インストールサービス

また、ご希望に沿ってGROMACSを事前インストールしています。
なお、GROMACSはインストール時、ビルドオプションを指定する必要があります。
弊社での事前インストールをご希望の場合は、下記の公式マニュアルを参考に、必要なビルドオプションをご指定ください。

参考:Installation guide – GROMACS 2024.1 documentation

 

本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。
いただいた条件に合わせて柔軟にマシンをご提案いたしますので、掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

 

 

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主な仕様

CPU AMD EPYC 9254 (2.90GHz 24コア)
メモリ 384GB ECC REG
ストレージ 1TB HDD S-ATA x4
ビデオ on board(VGA x1)
ネットワーク Intel X550 10GbE RJ45 2ポート
筐体+電源 1Uラックマウント筐体 + リダンダント電源800W
OS Ubuntu 22.04
その他 「あんしん+」3年引き取り修理保証、GROMACSインストール

キーワード

・GROMACSとは
GROMACS (Groningen Machine for Chemical Simulations) は、オランダのフローニンゲン大学で開発された分子動力学シミュレーションのパッケージ。主に、タンパク質や脂質、拡散などの生化学分子用に設計されている。

参考:GROMACS ※外部サイトに飛びます

事例追加日:2024/04/01
事例No.PC-11762

分子動力学シミュレーション用マシン (64コアモデル)

用途:分子シミュレーション、分子動力学計算
参考価格:2961200

お客さまからのご相談内容

これまで他社製のマシンを分子動力学シミュレーション用に使用していたが、故障等が多いためマシンの更新を検討している。
予算300万円程度で、上記の用途に適した構成を提案してほしい。現在使用しているマシンのスペックは以下の通り。

CPU:Intel Xeon Gold 6242R (3.10GHz 20コア)
メモリ:192GB REG ECC
ストレージ:4TB HDD S-ATA
ビデオ:NVIDIA RTX A4500 20GB
OS: Windows 11 Pro for Workstations
保証期間:3年

現在のマシンは、分子動力学シミュレーションで分子集合体のMD計算と一般的な解析に使用しており、機械学習での利用も考えている。また、MD計算のために夜通し連続稼働させることが多い。

今回導入を検討するマシンでは計算時間を短縮したいので、現在使用しているマシンよりも高性能なCPUを搭載したい。
加えて、VMDを用いての視覚的な分子集合系の確認や機械学習での使用も考えているため、最適なビデオカードが必要だと考えている。

なお、量子化学計算は頻繁には行わないため、メモリは現行と同程度で充分だと考えている。
反対に、ストレージ容量はいまの4TBでは足りないため、20TB程度のHDDを希望する。

テガラからのご提案

お客さまご希望の条件に沿った構成をご提案しました。

第4世代Xeon Scalableの2CPU構成

2024年3月時点で最新の第4世代Xeon Scalableシリーズを搭載したデュアルCPU構成です。
合計64のコア搭載数により、Intel Xeon Gold 6242Rと比較してもMD計算時のより高いパフォーマンスが期待できます。

NVIDIA RTX A4500 20GBで機械学習は可能?

ビデオカードはご予算に合わせて、ご利用中のマシンと同じNVIDIA RTX A4500 20GBを選択しています。ご利用予定のソフトウェア「VMD」のシステム要件において、ビデオカードは“OpenGLでのハードウェアアクセラレーション可能なビデオカードを強く推奨”とのみ記載があります。NVIDIA RTX A4500 20GBはミドルレンジのワークステーション向け製品であり、OpenGL 4.6にも対応しているため、VMDの利用に十分なスペックを持っていると考えられます。
また、ビデオカードの性能はハードウェアアクセラレーションに対応したソフトウェアなど、一部の処理を除いて大きく影響しないのに対し、CPUのスペックは全体の処理性能に直結するため、GPUよりもCPUを重視した構成としています。今後DeepLearningなども行う場合、NVIDIA RTX A4500 20GBは推論用途には十分なパフォーマンスが期待できますが、学習用途にはスペックが不足してしまう可能性がありますのでご注意ください。

また、本マシンの電源容量は現在の構成用に選定されているため、GPUの増設分などが考慮されていません。
GPUの増設など消費電力の大きい機器を増設する予定がある場合は、より大容量電源ユニットへの変更も可能ですのでお気軽にご相談ください。

 

本事例の構成は、お客様から頂戴した条件を元に検討した内容です。
いただいた条件に合わせて柔軟にマシンをご提案いたしますので、掲載内容とは異なる条件でご検討の場合でも、お気軽にご相談ください。

お客様の声 AIモデル開発 環境整備のためのお役立ち情報
AIモデル開発向けマシン選定のポイント 材料工学・マテリアル研究向けマシン選定のポイント
テグシスの延長保証サービス「あんしん+」 HDD返却不要サービス

 

 

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通常24時間以内に担当者からご連絡いたします

 

 

主な仕様

CPU Intel Xeon Gold 6438Y+ (2.00GHz 32コア) x2
メモリ 256GB REG ECC
ストレージ 20TB HDD S-ATA
ビデオ NVIDIA RTX A4500 20GB
ネットワーク on board (10GBase-T x2)
筐体+電源 タワー型筐体 + 1000W
OS Microsoft Windows 11 Professional 64bit
その他 「あんしん+」3年引き取り修理保証

 

■キーワード

・VMDとは

VMD (Visual Molecular Dynamics) は、イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校の理論・計算物理学グループによって開発されている分子モデリングソフトウェア。3Dグラフィックを用いて分子をモデリング・可視化・解析することができ、MacOS X、Unix、Windowsに対応している。

参考:VMD – Visual Molecular Dynamics ※外部サイトに飛びます

・DeepLearningとは
DeepLearningは機械学習の一種であり、多層のニューラルネットワークを用いて高度なパターン認識や予測を行う手法。一般的に大量のデータを必要とするため、データが豊富な場合に効果的な手法とされている。 また、DeepLeanigは画像認識や音声認識、自然言語処理などの分野で広く用いられている。複雑な特徴や関係性を学習することができるため、従来の機械学習手法よりも高い精度を発揮することができる。

参考:【特集記事】機械学習ってなんだろう ※弊社オウンドメディア「TEGAKARI」に飛びます

 

 

事例追加日:2024/03/11

ご注文の流れ

お問い合わせフォームよりご相談内容をお書き添えの上、 お問い合わせください。
(お電話でもご相談を承っております)
弊社より24時間以内にメールにてご連絡します。
必要に応じてメールにて打ち合わせさせていただいた上で、 メール添付にてお見積書をお送りします。
お見積もり内容にご納得いただけましたら、メールにてご注文ください。
ご注文確定後、必要な部材を手配し PCを組み立てます。
(掛売りの場合、最初に新規取引票のご記入をお願いしております)
動作チェックなどを行い、納期が確定いたしましたらご連絡いたします。
(納期は仕様や製造ラインの状況により異なります)
お客様のお手元にお届けいたします (ヤマト運輸/西濃運輸)

お支払い方法

お支払い方法は、お見積もりメール・お見積書でもご案内しています。

法人掛売りのお客様
原則として、月末締、翌月末日払いの後払いとなります。
学校、公共機関、独立行政法人のお客様
納入と同時に書類三点セット(見積書、納品書、請求書)をお送りしますのでご請求金額を弊社銀行口座へ期日までにお振込み願います。
先に書面での正式見積書(社印、代表者印付)が必要な場合はお知らせください。
企業のお客様
納品時に、代表者印つきの正式書類(納品書、請求書)を添付いたします。
ご検収後、請求金額を弊社銀行口座へお支払い期日までにお振込み願います。
銀行振込(先振込み)のお客様
ご注文のご連絡をいただいた後、お振込みを確認した時点で注文の確定とさせていただきます。

修理のご依頼・サポートについて

弊社製PCの保証内容は、お見積もりメールでもご案内しています。

■お問合せ先
テガラの取り扱い製品に関する総合サポート受付のWEBサイトをご用意しております。
テガラ株式会社 サポートサイト

※お問い合わせの際には、「ご購入前」と「ご購入後」で受付フォームが分かれておりますので、ご注意ください。

メール support@tegara.com
電話 053-543-6688

■テグシスのサポートについて
保証期間内の修理について

保証期間内におけるハードウェアの故障や不具合につきましては、無償で修理いたします。
ただし、お客様による破損や、ソフトウェアに起因するトラブルなど保証規定にて定める項目に該当する場合は保証対象外となります。
保証期間経過後も、PCをお預かりしての初期診断は無料で実施しております。

無料メール相談
PCの運用やトラブルにつきまして、メールでのご相談を承ります。経験・知識の豊富な技術コンサルタントが無料でアドバイスいたします。
※調査や検証が必要な場合はお答えできなかったり、有償対応となることがあります

オプション保証サービス

「あんしん+」 もしもの時の延長保証サービス

PCのご購入時にトータル5年までの延長保証をご選択いただけます。また、ご購入後にも延長保証を申し込むことができます。
延長を申し込みいただきますと、標準保証と同等の保証を期間満了まで受けることができます。
なお、PCの仕様によっては料金が異なる場合があります。

延長保証あんしん+ ご加入のタイミング
※仕様によっては保証期間の延長ができない場合があります。

HDD返却不要サービス

保証期間内にPCのHDD(SSD)が故障した場合、通常、新品のHDDとの交換対応となり、故障したHDDはご返却いたしません。
しかしこの「HDD返却不要サービス」にご加入いただければ、保証期間内にHDD(SSD)が故障した場合には新品のHDDをご提供いたしますが、故障したHDDを引き渡していただく必要はありません。お客さまの大切なデータの入ったHDDをお手元に保管しておくことができます。

オンサイト保守サポート

故障発生時、必要に応じエンジニアスタッフが現地へ訪問し、保守対応を行うサービスです。
発送にかかる手間、時間を短縮できますので、緊急性の高い保守に最適です。

費用ご参考(目安)
本体+延長保証代金の10%~
※ 製品の性質や価格帯、条件等により異なります。
★TEGSYS オンサイト保守利用規約はこちら (pdf)
お客様のご要望をうかがい、最適なPCの構成をご提案する
「お客様だけのオーダーメイドPC」を製作しています。
用途に応じた細かなアドバイスや迅速な対応がテガラの強みです。

上記の仕様はテガラでお客様に提案したPC構成の一例です。
掲載内容は提案当時のものであり、また使用する部材の供給状況によっては、現在では提供がむずかしいものや、部材を変更してのご提案となる場合がございます。

参考価格については、提案当時の価格(送料込・税込)になります。
ご相談時期によっては価格が異なる場合がございますので、あらかじめご了承ください。