PC提案事例

タンパク質の立体構造を解析するツール「AlphaFold2」を使用するためのマシンを検討したい。
事例No.PC-9327と同程度のマシンを考えている。

PC-9327の構成は一部パーツが終息しているため、ほぼ同一のアーキテクチャーを採用するXeon W-2200シリーズを採用した仕様で検討しました。

AlphaFold2の計算処理は、GPU性能の影響を受ける部分がかなり大きいことや、約2.7TBのデータベースに計算中も頻繁にアクセスするため、データベースを格納するストレージデバイスの性能が使用感に大きく影響します。
本構成ではコストを優先する方針で、データベース用のストレージを4TBのHDDとしていますが、速度重視の場合には事例No.PC-10260Aをご検討ください。

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G protein-coupled receptors,AlphaFold2,protein structure prediction,structural biology

DeepLabCut ver2.2の動作要件を満たす構成のPCが欲しい。
Geforce RTX3090を1枚搭載した構成を想定しているが、将来的には増設して2GPU構成にしたい。
その他、DeepLubCutやTensorflowのインストールを含めた状態での出荷を希望する。

DeepLabCutの最新版をインストールした構成にてお見積もりしました。
ただし、DeepLabCutは有志によって開発されている無償ソフトウェアのため、バージョンによっては挙動が安定しないことがあります。
セットアップの過程において、最新版の利用が難しいと判断した場合は、動作確認済みのバージョンにて提供させていただく可能性があります。

なお、TensorflowはDeepLabCutの動作に必須であるため、DeepLabCutのセットアップをご要望いただいた際には合わせてインストールを行っています。

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PC-9193を見ての問い合わせ。
タンパク質立体構造予測プログラム「AlphaFold2」を利用するためのマシンを希望。
条件は以下の通り。

・CPU：Xeon Silver 程度
・メモリ：128GB以上
・ストレージ：512GB SSD M.2
・GPU：NVIDIA RTX A4500等 (ビデオメモリが多いほど良い)
・ネットワーク：1G x1ポート
・OS：Ubuntu (インストール不要)
・その他：周辺機器類は不要
・予算：100万円程度

Xeon Silver 4316を1基搭載した構成でのご提案です。
ストレージはM.2タイプのSSDですが、512GBと容量が多くありません。
仕様上、M.2スロットは1つのみとなるため、将来的に同タイプの高速ストレージの追加が難しいことをご承知おきください。
一方で、PCI-Expressには複数の空きがありますので、アドインカードタイプのNVMe対応SSDを増設することが可能です。ご希望の際には気兼ねなくご相談ください。

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G protein-coupled receptors,AlphaFold2,protein structure prediction,structural biology

DeepLearningを始めたいので、入門用のマシンを導入したい。
希望するスペックは以下の通り。

・CPU：指定はないので、適切なものを提案して欲しい。
・メモリ：32GB
・ストレージ：500GB SSD M.2
・OS：Windows11
・GPU：適切なものを提案して欲しい。
・マウス・キーボード：無線タイプ
・予算：50万円前後

ご指定の条件を満たす構成を検討しました。
CPUとビデオカードはご予算内で導入できる組み合わせとしていますが、計算の高速化やプログラミングのためのGPGPU・CUDA利用でも過不足のない構成としています。
お客様へのヒアリングでは、DeepLearning初心者に向けたマシン導入・テスト的な導入というお話でしたので、以下の点に配慮したご提案となっています。

・CPUとビデオカードはご予算内で導入できる組み合わせ
・GPGPUやCUDAを入門的に使うにあたり、過不足のないスペック
・Anacondaパッケージサービス込み

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